Táto bakalárska práca zhŕňa poznatky v oblasti izolácie vakuol zo suspenznej bunkovej kultúry a celých rastlín Arabidopsis thaliana ekotyp Landsberg erecta. Dopĺňa poznatky spojené s experimentami naväzovania magnetických mikročastíc na ich povrch. Taktiež ukazuje metódy stanovenia čistoty izolovaných frakcií pomocou western blottingu. V závere sa zaoberá stanovením fytohormonálnych hladín auxínov a cytokinínov v týchto bunkových kompartmentoch metódami kvapalinovej chromatografie spojenej s hmotnostnou spektrometriou (LC-MS).This bachelor thesis summarizes the knowledges in the filed of isolation vacuoles from suspension cell culture and plants Arabidopsis thaliana ecotype Landsberg erecta. It complements the knowledges associated with the experiments of binding the magnetic microparticles on their surface. This work also shows methods for determining the purity of isolated fractions by western-blotting and phytohormone levels of auxins and cytokinins in this subcellular compartments by liquid chromatography combined with mass spectrometry (LC-MS).