Perifyton jako společenstvo autotrofních i heterotrofních organismů, žijících na předmětech nebo substrátech ponořených ve vodě zastává důležitou úlohu v primární produkci a regulaci koloběhu živin přes rozhraní sediment-voda ve sladkovodním prostředí. Perifyton je klasifikován na haptobentos, který zahrnuje organismy přichycené k povrchu pevného podkladu a herpobentos, organismy vertikálně migrující v sedimentu nebo žijící na jeho povrchu. Tato práce je zaměřena na studium dvou základních složek perifytonu ? epipelon, který je zároveň složkou herpobentosu a epifyton, který patří mezi haptobentos. K tomuto účelu byly sbírány vzorky sedimentů a nárostů sinic na makrofytech během tří ročních období od podzimu roku 2011 do léta roku 2012 celkem na devíti lokalitách v okolí Vysokého Mýta. Vzorky sinic byly kultivovány v tekutém Z médiu nebo na agaru v Petriho miskách při laboratorní teplotě. Dále bylo zjišťováno druhové zastoupení na jednotlivých lokalitách, morfologická variabilita jednotlivých druhů a nakonec byla provedena izolace kmenů. Mezi izolovanými kmeny se nacházela např. Geitlerinema lemmermannii, Phormidium animale nebo Pseudanabaena galeata. Izolované kmeny budou použity k dalšímu studiu, konkrétně molekulární analýze sekvencí DNA a následné fylogenetické analýze vztahů mezi perifytickými sinicemi.Periphyton as a community of autotrophic and heterotrophic organisms living on objects or substrates submerged in water has an important role in the regulation of primary production and nutrient cycling across the sediment-water interface in freshwater environments. Periphyton is classified on haptobentos, which includes organisms attached to the surface of a solid substrate and herpobentos, vertically migrating organisms in sediment or living on its surface. This work is focused on the study of two basic components of periphyton - epipelon, which is also a component of herpobentos and epifyton, one of the haptobentos. For this purpose were collected samples of sediments and cyanobacterial mats on macrophytes in three seasons from autumn 2011 to the summer of 2012 in total of nine locations around the Vysoké Mýto. Cyanobacteria samples were cultured in a liquid Z medium or on agar in Petri dishes at room temperature. It was further investigated species representation in various localities, morphological variability of individual species and eventually were isolated strains. Among the isolated strains were found e.g. Geitlerinema lemmermannii, Phormidium animale or Pseudanabaena galeata. Isolated strains will be used to further study, namely molecular analysis of DNA sequences and subsequent phylogenetic analysis of the relationships between periphytic cyanobacteria.