Počet záznamů: 1  

Kvantově chemické vypočty termodynamických charakteristik tvorby dimeru methylovaných páru basí nukleových kyselin v plynné fázi

  1. Údaje o názvuKvantově chemické vypočty termodynamických charakteristik tvorby dimeru methylovaných páru basí nukleových kyselin v plynné fázi [rukopis] / Adam Pecina
    Další variantní názvyKvantově chemické vypočty termodynamických charakteristik tvorby dimerů methylovaných párů basí nukleových kyselin v plynné fázi
    Osobní jméno Pecina, Adam (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názQuantum chemical investigation of thermodynamic characteristics of formation of methylated DNA basis in vacuo
    Vyd.údaje2009
    Fyz.popis52 s. (60591 znaků) : grafy, tab. + CD ROM
    PoznámkaVed. práce Pavel Hobza
    Dal.odpovědnost Hobza, Pavel, 1946- (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Jurečka, Petr (oponent)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova kvantová chemie * 1-methyluracil dimer * termodynamické charakteristiky * methylated uracil dimer * High-level wave function and Density functional theory calculations * thermodynamical analyze
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programChemie
    Studijní oborBiofyzikální chemie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    94465-784453700.pdf01.2 MB31.12.2999

    Práce se zabývá srovnáním vysoce přesných kvantově mechanických výpočtů interakčních energií třinácti různých konformací systému 1-methyluracil dimeru, jakožto reprezentativního systému párů basí nukleových kyselin. Termodynamická analýza charakterizuje vzájemnou souhru enthalpie a entropie na vytváření preferovaných konformací systému.Theoretical analysis of the formation of 1-methyluracil dimer was performed. Stabilization energies of 13 different conformations were evaluated at a very high ab initio level by complete basis set limit calculations. In this work we compare accurate interaction energies estimated at CCSD(T)/CBS level with Density functional theory calculations DFT-D/BLYP/TZVP, DFTD/tpss/LP and with calculations of semiempirical methods SCC-DFTB and PM6-DH. All interaction energies were corrected for basis set superposition error (BSSE) with use of counterpoise correction. The thermodynamic characteristics were calculated using rigid rotor-harmonic oscillator-ideal gas approximations. Interaction enthalpie at 0 K were observed by including the zero point energies. Gibbs energies at various temperatures were calculated to include entropy influence. The present calculations allow us to make more general conclusions concerning the interplay of enthalpy and entropy in stabilizing DNA base pairs in vacuo.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.