Number of the records: 1  

Odvodenie PCR markerov špecifických pre B chromozóm ciroku Sorghum purpureo-sericeum a ich využitie pre selekciu B-pozitívnych jedincov

  1. Title statementOdvodenie PCR markerov špecifických pre B chromozóm ciroku Sorghum purpureo-sericeum a ich využitie pre selekciu B-pozitívnych jedincov [rukopis] / Natália Harnádková
    Additional Variant TitlesOdvodenie PCR markerov špecifických pre B chromozóm čiroku Sorghum purpureosericeum a ich využitie pre selekciu B-pozitívnych jedincov
    Personal name Harnádková, Natália, (dissertant)
    Translated titleDevelopment of PCR markers specific for the B chromosome in Sorghum purpureosericeum and their application in screening for B-positive individuals
    Issue data2022
    Phys.des.50 s : il., schémata, tab.
    NoteVed. práce Miroslava Karafiátová
    Oponent Pavla Christelová
    Another responsib. Karafiátová, Miroslava (thesis advisor)
    Christelová, Pavla (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Keywords cirok * Sorghum purpureo-sericeum * B chromozóm * špecifické markery * PCR * Sorghum * Sorghum purpureo-sericeum * B chromosome * specific markers * PCR
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languageslovenština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00275179-501814348.pdf91.6 MB05.05.2022
    PosudekTyp posudku
    00275179-ved-325548245.pdfPosudek vedoucího
    00275179-opon-213092409.pdfPosudek oponenta

    B chromozómy sú nadpočetné chromozómy nachádzajúce sa v rastlinách, živočíchoch a hubách. Typickým znakom je, že sa ich prenos neriadi mendelovskou dedičnosťou, preto sa ich počet môže líšiť v rámci jedincov toho istého druhu aj v rámci pletív toho istého jedinca. Sorghum purpureo-sericeum je planý diploidný druh, ktorý disponuje týmito chromozómami, a u ktorého bola preukázaná ich prítomnosť iba v generatívnych orgánoch. Cieľom tejto práve bolo odvodiť PCR špecifické markery, ktoré by vykazovali špecifickosť v prostredí Direct PCR s možnosťou ich využitia pri detekcii B chromozómu v endosperme a selekcii B-pozitívnych jedincov. Pre experiment bolo navrhnutých celkovo 29 párov primerov špecifických pre B chromozóm, ktoré boli testované na DNA jedincoch vybraných líniách izolovaných tromi rôznymi kitmi. Testovanie pomocou metódy PCR preukázalo špecifickosť 2 markerov. Bohužiaľ však ani jeden marker nebo špecifický v prostredí Direct PCR a pre detekciu B chromozómu v endosperme tak bude nutné použiť alternatívny prístup izolácie DNA z limitovaného množstva pletiva.The B chromosomes are supernumerary chromosomes that have been found in plants, animals and fungi. Typically their transmission is not governed by Mendelian inheritance, so their number may vary within individuals of the same species, as well as within the tissues of the same individual. Sorghum purpureo-sericeum is a wild diploid species carrying this kind of chromosomes and their presence has been proven almost exclusively in generative organs. The aim of the thesis was to develop B-specific PCR markers that would reliably work in Direct PCR with application in detection of the B chromosome in the endosperm and selection of B-positive individuals. A total of 29 pairs of B-specific primers were designed for the experiment and tested in selected lines. Out of all, 2 markers were found to be B-specific. Nevertheless, non of them did not target B chromosome sequence reliably in Direct PCR and alternative approach of mini DNA isolation have to be used to detect the B chromosome in endosperm.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.