Number of the records: 1  

Úloha transkripčních faktorů Sp1 a Sp3 v aktivním demetylačním procesu u buněk mnohočetného myelomu

  1. Title statementÚloha transkripčních faktorů Sp1 a Sp3 v aktivním demetylačním procesu u buněk mnohočetného myelomu [rukopis] / Michaela Němcová
    Additional Variant TitlesÚloha transkripčních faktorů Sp1 a Sp3 v aktivním demetylačním procesu u buněk mnohočetného myelomu
    Personal name Němcová, Michaela, (dissertant)
    Translated titleThe role of transcription factors Sp1 and Sp3 in the active demethylation process of multiple myeloma cells
    Issue data2022
    Phys.des.55 s.
    NoteVed. práce Kateřina Trtková
    Oponent Jiří Voller
    Another responsib. Trtková, Kateřina (thesis advisor)
    Voller, Jiří (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00271794-985651587.pdf5988.1 KB29.07.2022
    PosudekTyp posudku
    00271794-ved-702341334.pdfPosudek vedoucího
    00271794-opon-662026782.pdfPosudek oponenta

    Diplomová práce charakterizuje transkripční faktory Sp1 a Sp3 se zaměřením na jejich dosud nepopsanou úlohu v aktivním demetylačním procesu u buněk mnohočetného myelomu. Teoretická část nejprve shrnuje obecné poznatky o mnohočetném myelomu se zaměřením na projevy onemocnění a diagnostiku. Charaktzerizuje enzymy TET (Ten-eleven translocation) a detailněji zpracovává část věnovanou transkripčním faktorům Sp1 a Sp3 s důrazem na jejich strukturu, úlohu v procesech regulace transkripce genů, a posttranskripční modifikace. Experimetnální část je zaměřena na expresní a metylační analýzy myelomových buněčných linií KMS12-PE a KMS12-BM ovlivněných demetylačními činidly, a nesortované populace buněk získané z aspirátu kostní dřeně pacientů monoklonální gamapatie nejasného významu a nově diagnostikovaných pacientů mnohočetného myelomu. Pomocí imunoprecipitační analýzy bylo zjištěno, že u myelomových linií se transkripční faktor Sp1 po ovlivnění demetylačními činidly váže do promotorové sekvence genu TET1, zatímco vazba Sp3 na promotorový úsek sledovaných genů TET nebyla prokázána. Metylační změny byly nejčastěji detekovány v oblastech promotorů genů TET2 a TET3, a to jak u myelomových linií po ovlivnění demetylačními činidly, tak u pacientských vzorků. Signifikantní zvýšení exprese však bylo pozorováno u ovlivněných myelomových linií pouze v případě genu TET2. U vzorků MGUS byly hodnoty relativní exprese vyšší než hodnota 1,000 pozorovány u všech genů TET, a to i přes to, že v těchto případech byla detekovaná metylace CCGG ve sledovaných promotorových sekvencí.This thesis characterizes the transcription factors Sp1 and Sp3, focusing on their role in the active demethylation process in multiple myeloma cells. The theoretical part summarizes information about multiple myeloma with a focus on disease manifestations and diagnosis. It characterizes TET enzymes and in detail focuses on transcription factors Sp1 and Sp3 with an emphasis on their structure, role in gene expression, and posttranscription modification. Myeloma cell lines KMS12-PE and KMS12-BM, and unsorted cell populations of multiple myeloma and monoclonal gammopathy of undetermined significance patiens were analyzed. The experimental part is focused on the still undescribed role of both transcription factors Sp1 and Sp3 in the active demethylation process in multiple myeloma cells, as well as determination of methylation and hydroxymethylation changes in the promoter regions of TET1, TET2 and TET3 genes. The results of ChIP analysis indicate that after treatment of the myeloma cells with demethylation agents, Sp1 binds to the promoter of TET1, while Sp3 binding to the TET1 has not be found. Methylation changes were mostly detected in the promoters of TET2 and TET3 genes in both, treated cell lines and patient samples. On the contrary, in treated cell lines a significant increase in expression was detected only in case of TET2. An increase in relative expression was detected in some MGUS samples for all TET genes, despite the detecting of methylation changes in the analyzed promoters.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.