Number of the records: 1
Role SMC5/6 komplexu v opravách poškození DNA u Arabidopsis thaliana
Title statement Role SMC5/6 komplexu v opravách poškození DNA u Arabidopsis thaliana [rukopis] / David Šimek Additional Variant Titles Role SMC5/6 komplexu v opravách poškození DNA u Arabidopsis thaliana Personal name Šimek, David, (dissertant) Translated title Arabidopsis thaliana SMC5/6 complex function in DNA damage repair Issue data 2021 Phys.des. 62 : il., grafy, tab. Note Oponent Jitka Prachařová Ved. práce Eva Tomaštíková Another responsib. Prachařová, Jitka (opponent) Tomaštíková, Eva (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords SMC5/6 komplex * Arabidopsis thaliana * KU70 * LIG4 * oprava poškození DNA * SMC5/6 complex * Arabidopsis thaliana * KU70 * LIG4 * DNA damage repair Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00268978-878487890.pdf 0 2.6 MB 29.07.2024 Posudek Typ posudku 00268978-ved-566434808.pdf Posudek vedoucího 00268978-opon-272352017.pdf Posudek oponenta
SMC5/6 proteinový komplex je klíčovým faktorem udržování integrity genomu a účastní se mimo jiné i oprav dvouvláknových zlomů DNA pomocí homologní rekombinace. Zapojení jednotlivých podjednotek SMC5/6 proteinového komplexu v drahách oprav poškození DNA bylo donedávna ne zcela jasné. Tato práce se zaměřuje na podjednotky SMC6B a NSE4A, které jsou součástí tohoto komplexu. Cílem práce bylo popsat genetickou interakci mezi funkcí SMC5/6 komplexu a další drahou zapojenou v opravách dvouvláknových zlomů, kterou je spojování nehomologních konců. Konkrétně byly předmětem našeho zájmu proteiny KU70 a LIG4. Za účelem prohloubení znalostí v této oblasti byli selektováni dvojití mutanti A. thaliana mezi podjednotkami SMC5/6 komplexu a již zmíněnými proteiny opravné dráhy spojování nehomologních konců. Dále byly hodnoceny fenotypy selektovaných dvojitých mutantů na kultivačním médiu bez genotoxických chemikálií a dvěma různými metodickými přístupy testována jejich senzitivita vůči vybraným genotoxickým chemikáliím na tuhém i v tekutém kultivačním médiu.SMC5/6 protein complex is a key factor of maintaining genome stability. One of the important functions is repair of DNA double-strand breaks via homologous recombination. The role of SMC5/6 complex subunits in specific DNA damage repair pathways is not fully understood. This thesis is focused on SMC6B and NSE4A subunits of the SMC5/6 complex. Here, we focused on genetic interaction with the components of non-homologous end joining pathway that represents another double strand break repair pathway. Specifically, we focused on KU70 and LIG4 proteins. Firstly, we selected the double mutants lines in the SMC5/6 complex subunits and the KU70 and LIG4. Next, we analyzed growth phenotypes of the double mutants under ambient conditions. Lastly, we tested sensitivity to specific DNA-damaging agents and compared two cultivation techniques using both solid and liquid growth media.
Number of the records: 1