Filipíny jsou souostrovní stát sestávající z více než 7 107 ostrovů. Leží v regionu Jihovýchodní Asie a jsou specifické většinovou populací vyznávající křesťanské náboženství. Toto je pozůstatkem z doby španělské okupace v regionu. V oblasti ostrova Mindanao se nachází velká muslimská komunita, která se snaží o nezávislost od ústřední Filipínské vlády. Spory o nezávislost a území vyústily v ozbrojený konflikt v roce 1969 a následný vznik povstaleckých organizací Národní osvobozenecká fronta Morů (MNLF - Moro National Liberation Front) a Islámská osvobozenecká fronta Morů (MILF - Moro Islamic Liberation Front). Práce nejprve popisuje obecnou charakteristiku geografické struktury a postavení Filipín v regionu. Následně autor definuje vybrané pojmy a rozebere podobu Islámu v Jihovýchodní Asii. Dále popisuje a analyzuje aktéry konfliktu a zájmy stran konfliktu na ostrově Mindanao. Mapuje vznik, vývoj a průběh nepřátelského konfliktu a jeho vliv na politiku Filipín. Práce se také zaměří na popis implementace mírových jednání a přiblíží vyjednávání mezi aktéry. Na závěr bude provedeno shrnutí příčin, jež vedou k opětovné eskalaci konfliktu a bojů v Bangsamoro Autonomním Regionu Muslimského Mindanaa.The Philippines are country consisting of more than 7 107 islands. They are situated in the region of Southeast Asia and are specific by ruling Christian majority in the region. This phenomenon is residue from Spanish presence in the region during colonial times. There is a great Muslim community in the south area of islands known as Mindanao region, which have tendency to independent themselves from central government of Philippines. The disagreement about the independence of the region escalated in armed conflict in 1969 and escalated in formation of organisations like MILF - Moro Islamic Liberation Front and MNLF - Moro National Liberation Front. At first, this work describes general characteristics of geographical structure and location of Philippines in global political system. Afterwards, the thesis describes and analyses some specific terms and describes the practices of Islam in Southeast Asia. This research also examines the parts in conflict and their intentions. Lately, the origin and progress of the conflict in Mindanao and its importance in global politics of Philippines will be described. The thesis also tracks the dynamic of conflict in present and mentions the peace negotiations that were initiated. The summary of elements, which have led to the escalation of conflict and which have consequences in the development of the region nowadays, will be written in the final part of the thesis.