Number of the records: 1  

Komparativní analýza subgenomů Pachycladon exilis

  1. Title statementKomparativní analýza subgenomů Pachycladon exilis [rukopis] / Lucie Šimková
    Additional Variant TitlesKomparativní analýza subgenomů Pachycladon exilis
    Personal name Šimková, Lucie (dissertant)
    Translated titleComparative analysis of Pachycladon exilis subgenomes
    Issue data2019
    Phys.des.51
    NoteVed. práce Jan Bartoš
    Oponent Radim Čegan
    Another responsib. Bartoš, Jan (thesis advisor)
    Čegan, Radim, (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor)
    Keywords Celogenomová duplikace * kolinearita * polyploidie * Pachycladon exilis * Whole genome duplication * polyploidy * collinearity * Pachycladon exilis
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiochemie
    Degreee disciplineBioinformatika
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00226199-871924200.pdf881.3 MB13.05.2019
    PosudekTyp posudku
    00226199-ved-209513080.pdfPosudek vedoucího
    00226199-opon-216101190.pdfPosudek oponenta

    Pachycladon exilis je mesopolyploidní druh endemický na Novém Zélandě, který vznikl z allopolyploidního předka před asi 2 miliony let. V rámci diplomové práce byla provedena komparativní analýza P. exilis s Arabidopsis lyrata, byly porovnávány subgenomu v rámci P. exilis a následně provedena komparativní analýza se sestaveným transkriptomem Crucihimalaya himalaica. Podařilo se vytvořit metodiku pro identifikaci kandidátních subgenomů P. exilis a jejich přiřazení k rodičovským genomům.Pachycladon exilis is a mesopolyploid species, endemic in New Zealand with an allopolyploid origin. This diploma thesis focuses on a comparative analysis of P. exilis and Arabidopsis lyrata, a comparison of P. exilis subgenomes and comparative analysis with Crucihimalaya himalaica. The thesis provide a methodology for identification of candidate subgenomes of P. exilis and their assignment to a potential evolutionary parental genomes.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.