Number of the records: 1
Sledování elektrostatického potenciálu na povrchu biomolekul
Title statement Sledování elektrostatického potenciálu na povrchu biomolekul [rukopis] / Jaroslava Geletičová Additional Variant Titles Sledování elektrostatického potenciálu na povrchu biomolekul Personal name Geletičová, Jaroslava (dissertant) Translated title Monitoring of the electrostatic surface potential on biomolecules Issue data 2013 Phys.des. 83 stran Note Ved. práce Martin Kubala Oponent Marika Janovská Another responsib. Kubala, Martin, 1977- (thesis advisor) Janovská, Marika (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biofyziky (degree grantor) Keywords tryptofanová fluorescence * zhášení fluorescence * iontová síla * ovlivnění efektivity zhášení * tryptophan fluorescence * quenching of fluorescence * ionic strength * influence on fluorescence quenching effectivity Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Fyzika Degreee discipline Molekulární biofyzika book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00183358-718548952.pdf 23 1 MB 26.04.2013 Posudek Typ posudku 00183358-ved-694039431.pdf Posudek vedoucího 00183358-opon-984167244.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00183358-prubeh-317539778.pdf 23.10.2012 26.04.2013 17.05.2013 1 Hodnocení známkou
Tato práce je zaměřena na problematiku tryptofanové fluoresence a zhášení fluorescence. Teoretická část stručně popisuje nutné teoretické základy včetně použitých proteinů. Modelovým fluoroforem je neutrální analog tryptofanu, NATA (N-acetyl-L-tryptofanamid). Modelovými proteiny pak byly HSA (albumin z lidského séra), BSA (albumin z hovězího séra) a série jednotryptofanových mutantů velkého cytoplazmatického segmentu C45 Na+/K+$-ATPasy. Blíže se tato práce zabývá vlivem iontové síly na efektivitu zhášení fluorescence. Experimenty byly provedeny pro široké spektrum iontových sil (50 - 750 mM) a pro dvě odlišná zhášedla. Prvním zhášedlem byl jodidový aniont, který umožňuje sledování elektrostatických interakcí. Druhým zhášedlem byl akrylamid, jež může být použit jako reference, protože nenese náboj. Poměr bimolekulárních zhášecích konstant pro akrylamid a pro jodid nese informace o elektrostatických interakcích mezi molekulami zhášedla a fluoroforem.This work is focused on tryptophan fluorescence and fluorescence quenching. Theoretical part briefly describes principles including description of proteins used for experiments. Model fluorophore is neutral tryptophan analog, called NATA (N-acetyl-L-tryptophanamide). Model proteins were HSA (human serum albumin), BSA (bovine serum albumin) and series of single-tryptophan mutants of the Na+/K+-ATPase. This work studies influence of ionic strength on fluorescence quenching effectivity. Experiments were done for wide range of ionic strength and for two different quenchers. The first quencher was iodide anion, which enables measuring of electrostatic interactions. Second quencher was acrylamide, which can be used as reference, because it has no charge. The ratio of bimolecular quenching constant for acrylamide and for iodide carries informations about electrostatic interactions between molecules of quencher and fluorophore.
Number of the records: 1