Tichá, Tereza
Využití Sonogashira cross-coupling reakce k přípravě 5-substituovaných derivátů cytosinu [rukopis] / Tereza Tichá. -- 2012. -- 34. -- Ved. práce Lucie Brulíková. -- Oponent Naděžda Cankařová. -- Abstract: Předložená bakalářská práce je zaměřena na syntézu derivátů cytosinu modifikovaných v poloze 5 rigidním systémem zakončeným heterocyklickým zbytkem pomocí tzv. Sonogashira cross-coupling reakce. Takováto modifikace může mít zásadní vliv na stabilitu DNA duplexu a významně tak ovlivňovat celou řadu biochemických procesů. Bakalářská práce je rozčleněna do dvou částí. První z nich je teoretická a klade si za cíl objasnit mechanismus základní reakce celé práce, tedy Sonogashira cross-coupling reakce, a rovněž vytvořit přehled o dosud známých derivátech cytosinu, jež jsou v poloze 5 modifikovány rigidním systémem. V této oblasti jsou popsány syntetické přístupy vedoucí k cílovým derivátům, možnosti jejich reaktivity a vliv modifikace cytosinu v poloze 5 na DNA. Diskusní část bakalářské práce sumarizuje výsledky získané během experimentální činnosti. Pozornost je nejprve zaměřena na přípravu výchozího substrátu - 5-ethynylcytosinu, optimalizaci reakčních podmínek a srovnání získaných výsledků s literaturou. Připravený 5-ethynylcytosin je dále využit k reakcím s vybranými heterocyklickými sloučeninami, přičemž cílové deriváty byly izolovány, purifikovány a charakterizovány pomocí NMR. Připravené sloučeniny budou v budoucnu inkorporovány do DNA/RNA a bude sledován vliv modifikace na stabilitu DNA/RNA duplexu.. -- Abstract: Presented bachelor thesis is focuses on synthesis of cytosine derivatives modified at the C5 position by rigid system which is terminated by heterocyclic ring employing the Sonogashira cross-coupling reaction. This type of modification could have essential effect on stability of DNA duplex and significantly affect large scale of biochemical processes. Bachelor thesis is divided into two parts. First part is theoretical and there is an attempt to explain the principle of basic reaction of whole work - Sonogashira cross-coupling reaction. Further, theoretical part is aimed at studies on known derivatives of cytosine which are C5 modified by rigid system. There are described synthetic methods leading to final derivatives, their reactivity and effect of modification of cytosine in C5 position on DNA. Discussion part of this work comprises the results achieved during experimental activity. Firstly, the preparation of starting material ? 5-ethynylcytosine is described. Further, the work is aimed at the optimization of reaction conditions and comparison of results described in literature. Prepared 5-ethynylcytosine is used for reactions with selected heterocyclic compounds to afford final substances that were isolated, purified and identified by NMR spectroscopy. Prepared structures will be incorporated into DNA/RNA in the future and the effect of modifications on stability of DNA/RNA duplex will be studied.
Brulíková, Lucie, 1980-. Cankařová, Naděžda. Univerzita Palackého. Katedra organické chemie
cytosin. ethynylcytosin. rigidní. cross-coupling. DNA. cytosine. ethynylcytosine. rigid. cross-coupling. DNA. bakalářské práce
(043)378.22