Number of the records: 1
Epigenetické aspekty protoplastových kultur
Title statement Epigenetické aspekty protoplastových kultur [rukopis] / Petr Cápal Additional Variant Titles Epigenetický profil protoplastových kultur Personal name Cápal, Petr (dissertant) Translated title Epigenetic aspects of the protoplast cultures Issue data 2012 Phys.des. 54 stran Note Oponent Božena Navrátilová Ved. práce Vladan Ondřej Another responsib. Navrátilová, Božena, 1956- (opponent) Ondřej, Vladan, 1975- (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords Epigenetika * protoplast * Cucumis sativus * chromatin * dediferenciace * Epigenetics * protoplast * Cucumis sativus * chromatin * dedifferentiation Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00140866-533791603.pdf 135 6.7 MB 24.04.2012 Posudek Typ posudku 00140866-ved-646592401.pdf Posudek vedoucího 00140866-opon-829172101.pdf Posudek oponenta Call number Barcode Location Sublocation Info DP-KBB/084 (PřF-KBO) 3134512545 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Rostlinná buňka po protoplastizaci projde dediferenciací, jejímž jedním z hlavních rysů je masivní dekondenzace heterochromatinu a změny na úrovni transkriptomu. Struktura chromatinu odráží epigenetický status dané části genomu. Jedná se zejména o metylaci DNA a modifikací aminoterminálních konců histonů. V této práci byla zkoumána míra metylace a hydroxymetylace DNA na celogenomové globální úrovni a stav metylace DNA v oblastech genů zapojených v procesech regenerace a kultivace protoplastů vzhledem k jejich expresi. Během prvních tří dní kultivace protoplastů dochází k poklesu celogenomové hladiny metylace DNA, zatímco úroveň hydroxymetylace roste. Pouze u dvou ze šesti sledovaných genů, PCNA a RNR, bylo prokázáno, že podstupují postupnou demetylaci, která koreluje s mírou jejich exprese. Repetice SAT1 a 5S rDNA si ponechávají i po dekondenzaci epigenetickou značku umlčeného chromatinu, metylovanou DNA. Oproti tomu oblast retroelementu Ty1-copia je postupně demetylována a v protoplastech dochází k jeho expresi.Plant cell after protoplastisation experiences dedifferentiation, one of its hallmarks is massive decondensation of heterochromatin and changes in transcriptome. Chromatin structure is given by epigenetic state of genome in current location, mainly by DNA methylation and modifications of histone tails. Concern of this work is global levels of whole-genome methylation and hydroxymethylation as well as methylation in particular regions of genes responsible for protoplast regeneration and cultivation. In the first three days of protoplast cultivation the level of global DNA methylation decreases, by that time level of hydroxymethylation rises. Only two of six examined genes, PCNA and RNR, showed demethylation of their loci, which correlate with their expression. SAT1 and 5S rDNA repeats maintain their DNA methylation after decondensation. On the contrary, retroelement Ty1-copia is gradually demethylated and is transcribed in protoplasts.
Number of the records: 1