Number of the records: 1
Analýza a charakteristika polymorfních cross-species mikrosatelitů u potápky roháče (Podiceps cristatus)
Údaje o názvu Analýza a charakteristika polymorfních cross-species mikrosatelitů u potápky roháče (Podiceps cristatus) [rukopis] / Jana Hoffmannová Další variantní názvy Analýza a charakteristika polymorfních cross-species mikrosatelitů u potápky roháče (Podiceps cristatus) Osobní jméno Hoffmannová, Jana (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz The analysis and characterization of polymorphic cross-species microsatellites for determination of paternity in Great Crested Grebe (Podiceps cristatus) Vyd.údaje 2013 Fyz.popis 80 s. (139 998 znaků) : tab. + 1 CD Poznámka Ved. práce Petr Nádvorník Oponent Vladan Ondřej Dal.odpovědnost Nádvorník, Petr (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Ondřej, Vladan, 1975- (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova mikrosatelity * cross-species PCR amplifikace * potápka roháč * Podiceps cristatus * microsatellites * cross-species PCR amplification * Great Crested Grebe * Podiceps cristatus Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biologie Studijní obor Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00171894-110173646.pdf 54 884.5 KB 31.07.2013 Posudek Typ posudku 00171894-ved-394091741.pdf Posudek vedoucího 00171894-opon-384889061.pdf Posudek oponenta Signatura Čár.kód Lokace Dislokace Info DP-KBB/118 (PřF-KBO) 3134517870 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad pouze prezenčně
Tuto diplomovou práci jsem zpracovávala na téma analýza a charakteristika polymorfních cross-species mikrosatelitů u potápky roháče (Podiceps cristatus). V teoretické části práce jsem se zabývala popisem čeledi potápkovitých, jakož i vlastního druhu potápky roháče, a jejímu fylogenetickému zařazení v rámci třídy ptáků. Dále jsem obecně vysvětlila pojem mikrosatelit a cross-species PCR amplifikace. Nakonec jsem charakterizovala mikrosatelitové lokusy vhodné pro testování u potápky roháče. Pro potápku roháče nebyly doposud popsány žádné polymorfní mikrosatelitové lokusy, cílem experimentální části mé práce tedy bylo jejich nalezení pomocí cross-species PCR amplifikace. Celkově jsem otestovala 407 mikrosatelitových lokusů, které zahrnovaly všechny známé lokusy odvozené od zástupců řádů potápek, potáplic, brodivých, veslonohých a plameňáků a dále několik vybraných lokusů odvozených od zástupců z řádů dlouhokřídlých, vrubozobých, tučňáků a sudokopytníků. Takto jsem nalezla 41 párů primerů amplifikujících 42 polymorfních lokusů (jeden pár primerů amplifikoval dva polymorfní lokusy). U všech lokusů jsem určila alelové konstituce na 13 nepříbuzných jedincích a následně je charakterizovala programy Cervus 3.0.3 a Genepop 4.1. Na základě těchto statistických dat jsem vybrala 4 polymorfní mikrosatelitové lokusy vhodné pro determinaci paternity u potápky roháče. Dále jsem u všech jedinců určila pohlaví a na základě toho detekovala 5 mikrosatelitových lokusů ve vazbě na pohlaví, z nichž jeden byl určitě, další tři pravděpodobně (bylo by možné potvrdit až po otestování většího počtu jedinců) vázáné na chromozom Z a pátý se choval jako pohlavní marker.I processed this master thesis on the topic of the analysis and characterization of polymorphic cross-species microsatellites in Great Crested Grebe (Podiceps cristatus). In the theoretical part of my thesis I focused on describing the family Grebes, as well as its own species Great Crested Grebe, and its phylogenetic classification within the class of birds. I also explained the general term microsatellite and cross-species PCR amplification. Finally, I characterized microsatellite loci suitable for testing in Great Crested Grebe. For Great Crested Grebe have not been described any polymorphic microsatellite loci yet, so the aim of the experimental part of my thesis was their finding using cross-species PCR amplification. Overall, I tested 407 microsatellite loci, which included all known loci derived from representatives of the orders grebes, loons, storks, pelecaniformes and flamingos as well as several selected loci derived from representatives of the orders charadriiformes, ducks, penguins and ungulates. Thus I found 41 primer pairs that amplified 42 polymorphic loci (one primer pair amplified two polymorphic loci). For all loci I identified allelic constitution in 13 unrelated individuals and subsequently characterized by the programs Cervus 3.0.3 and Genepop 4.1. Based on these statistical data, I chose four polymorphic microsatellite loci suitable for determination of paternity in Great Crested Grebe. I also determined sex in all individuals and based on of this I detected 5 sex-linked microsatellite loci, one of which was certainly, three more probably (it would be confirmed after testing a larger number of individuals) linked to chromosome Z and fifth acted as a marker for sex determination.
Number of the records: 1