Number of the records: 1  

N-acetylaminotransferasa z mechu Physcomitrella patens

  1. Title statementN-acetylaminotransferasa z mechu Physcomitrella patens [rukopis] / Jan Tancer
    Additional Variant TitlesN-acetylaminotransferasa z mechu Physcomitrella patens
    Personal name Tancer, Jan, (dissertant)
    Translated titleN-acetylaminotransferase from moss Physcomitrella patens
    Issue data2021
    Phys.des.67
    NoteOponent Lenka Luhová
    Ved. práce David Kopečný
    Another responsib. Luhová, Lenka (opponent)
    Kopečný, David (thesis advisor)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor)
    Keywords acetylace * heterologní exprese * Physcomitrella patens * polyaminy * transferasa * acetylation * heterologous expression * Physcomitrella patens * polyamines * transferase
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiochemie
    Degreee disciplineBiochemie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00271350-320882263.pdf252.5 MB11.05.2021
    PosudekTyp posudku
    00271350-ved-461612315.pdfPosudek vedoucího
    00271350-opon-288872548.pdfPosudek oponenta

    Tato bakalářská práce je věnována N-acetylaminotransferase (NATA) z mechu Physcomitrella patens. V teoretické části je popsán metabolismus polyaminů, jejich syntéza a degradace se zaměřením na acetylaci a známé enzymy u rostlin a savců. V experimentální části byl klonován gen PpNATA do expresního vektoru pET-28a. Expresí genu v buňkách E.coli byl získán rekombinantní protein obsahující histidinovou kotvu umožňující purifikaci afinitní chromatografií. Pomocí metody SDS-PAGE byla ověřena produkce proteinu, čistota a metodou nano-diferenciální skenovací fluorimetrie bylo ověřena stabilita proteinu a stabilizace vazbou na acetyl-CoA. Pomocí bioinformatických postupů byla predikována sekundární a terciární struktura proteinu na základě dostupných struktur savčí N-acetylaminotransferasy a dále bylo analyzováno vazebné místo pro vazbu acetyl-CoA v modelu PpNATA.This bachelor thesis is focused on the N-acetyl aminotransferase (NATA) from the moss Physcomitrella patens. The theoretical part describes the metabolism of polyamines, their synthesis and degradation with a focus on acetylation and known enzymes in plants and mammals. In the experimental part, the PpNATA gene was cloned into the expression vector pET-28a. The gene was expressed in E. coli cells yielding a recombinant protein comprising a histidine-tag allowing the affinity chromatography purification. The protein production and purity were verified by SDS-PAGE, and protein stability and the effect of acetyl-CoA binding was analyzed by the nano-differential scanning fluorimetry. Bioinformatic approaches were used to predict the secondary and tertiary structure of the protein was predicted based on the available structural data of N-acetyl aminotransferases, and the binding site for acetyl-CoA in the PpNATA model was further analyzed.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.