Number of the records: 1
Studium Na+/K+-ATPázy pomocí molekulárně-dynamických simulací
Title statement Studium Na+/K+-ATPázy pomocí molekulárně-dynamických simulací [rukopis] / Petra Čechová Additional Variant Titles Studium Na+/K+-ATPázy pomocí molekulárně-dynamických simulací Personal name Čechová, Petra (dissertant) Translated title Molecular dynamics studies of Na+/K+-ATPase Issue data 2013 Phys.des. 41s : il., grafy, tab. Note Ved. práce Martin Kubala Oponent Petr Jurečka Another responsib. Kubala, Martin, 1977- (thesis advisor) Jurečka, Petr (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biofyziky (degree grantor) Keywords N/K ATPasa * DPPC * DSPC * POPE * MARTINI * molekulární dynamika * N/K ATPase * DPPC * DSPC * POPE * MARTINI * molekular dynamics Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Fyzika Degreee discipline Molekulární biofyzika book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00184032-795081958.pdf 28 2.8 MB 26.04.2013 Posudek Typ posudku 00184032-ved-490032692.pdf Posudek vedoucího 00184032-opon-147492244.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00184032-prubeh-940111695.pdf 23.10.2012 26.04.2013 17.05.2013 2 Hodnocení známkou
Tato diplomová práce využívá metod výpočetní chemie ke zkoumání chování Na+/K+-ATPasy. Pomocí silového pole MARTINI je vytvořen model tohoto proteinu v membránách složených z různých lipidů (DSPC, DPPC, POPE), na kterém je následně pomocí molekulární dynamiky provedena simulace jeho chování po dobu 1 ?s. U takto získaných dat jsou pak sledovány konformační změny proteinu, pohyb iontů a rozložení lipidů v membráně.This thesis uses computational chemistry methods to study the behavior of Na+/K+-ATPase. Using MARTINI force field, we model the protein in membranes consisting of different lipids (DSPC, DPPC, POPE). The behavior of system on the timescale of 1 ?s is then simulated by using molecular dynamics. Obtained data are analysed with respect to conformational changes of the protein, ion movement and radial distribution of lipid molecules in the membrane.
Number of the records: 1