Endofyté jsou definovány jako organismy žijící uvnitř rostlin, aniž by způsobovaly symptomy chorob. Endofytismus byl potvrzen u mnoha druhů organismů, v této práci bylo pracováno s endofytickými houbami Serendipita indica a Microdochium bolleyi a houbovými patogeny Ceratobasidium cereale a Fusarium culmorum a byl sledován jejich vliv na růst rostliny Triticum aestivum, nekrotizaci listů a zvýšení odolnosti rostlin související s expresí genů spojených s rostlinou imunitou; geny spojené s patogenezí 1 (PR1) a chitinázy (B2H2). Patogenní houby F, culmorum a C. cereale vyvolaly vyšší expresi genů chitinázy než endofytické houby S. indica a M. bolleyi. V budoucnu by endofyté mohly hrát významnou roli v biologické ochraně rostlin, a sloužit jako náhrada pesticidů, případně by se mohly uplatnit jako producenti sekundárních metabolitů s využitím ve farmakologii.This bachelor thesis focuses on endophytes, defined as organisms living inside plants that do not cause disease symptoms. There are many endophytes, but this thesis worked with Serendipita indica and Microdochium bolleyi and their effect on the plant compared to the effect of pathogens Ceratobasidium cereale and Fusarium culmorum. The effect of endophytes on the plant was studied in leaf necrosis, growth and expression of plant genes associated with plant immunity, pathogenesis-related gene 1 (PR1) and chitinase (B2H2). F. culmorum and C. cereale induced higher expression of chitinase genes than endophytes. In the future, endophytes could play a biocontrol role, as substitutes for herbicides, pesticides, and fungicides or as producers of secondary metabolites for pharmacology.