Number of the records: 1
Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu brodiví u čápa simbila (Ciconia abdimii)
Title statement Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu brodiví u čápa simbila (Ciconia abdimii) [rukopis] / Klára Nevimová Additional Variant Titles Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu brodiví u čápa simbila (Ciconia abdimii) Personal name Nevimová, Klára (dissertant) Translated title Cross-species amplification of microsatellites from Ciconiiformes in Abdim's Stork (Ciconia abdimii) Issue data 2012 Phys.des. 64 s. Note Ved. práce Petr Nádvorník Oponent Miloslav Kitner Another responsib. Nádvorník, Petr (thesis advisor) Kitner, Miloslav (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords čáp simbil (Ciconia abdimii) * mikrosatelity * polymorfizmus * polymerázová řetězová řeakce (PCR) * elektroforéza v polyakrylamidovém gelu * Abdim´s Stork (Ciconia abdimii) * microsatellites * polymorphism * polymerase chain reaction (PCR) * PolyAcrylamide Gel Electrophoresis Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00158507-263124246.pdf 32 271.7 KB 30.04.2012 Posudek Typ posudku 00158507-ved-584499410.pdf Posudek vedoucího 00158507-opon-387115305.pdf Posudek oponenta Call number Barcode Location Sublocation Info BP-KBB/141 (PřF-KBO) 3134512532 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Náplní mojí bakalářské práce byla cross-species amplifikace polymorfních mikrosatelitů z řádu brodiví u čápa simbila. V teoretické části jsem se zabývala charakteristikou čápa simbila (Ciconia abdimii) a taxonů, do kterých se zařazuje. Dále jsem se zabývala problematikou mikrosatelitů a metodami, které jsem použila v experimentální části. Náplní experimentální části mojí práce bylo hledání polymorfních mikrosatelitních lokusů. Touto metodou jsem testovala 187 párů primerů. Pro testování polymorfních mikrosatelitových lokusů jsem použila všechny publikované primery z řádu brodivých, potápek a potáplic. Dále jsem testovala několik vybraných mikrosatelitových primerů z řádu dlouhokřídlých a tučňáků. Za účelem ověření fylogenetické nepříbuznosti jsem použila i několik mikrosatelitových primerů z řádu vrubozobých. Pro detekci polymorfních lokusů jsem použila metodu cross-species PCR amplifikace u 6 nepříbuzných jedinců čápa simbila. Následně byly PCR produkty separovány v polyakrylamidovém gelu. Postupným testováním bylo nalezeno 26 polymorfních mikrosatelitních lokusů. U těchto lokusů byla zoptimalizována teplota annealingu a čas elektroforetické separace. Počet nalezených alel se pohyboval v rozmezí 2-6 alel na lokus. U jednoho mikrosatelitového lokusu byla nalezena nulová alela. Nejvíce polymorfních lokusů poskytly mikrosatelitové primery odvozené od nesyta lesního (Mycteria americana) a čápa bílého (Ciconia ciconia).This thesis deals with a cross-species amplification polymorphic microsatellites from Ciconiiformes in Abdim's Stork (Ciconia abdimii). The main focus of the theoretical part is a description of Abdim´s Stork and taxons to which it belongs. Further more it gives an account of issues that are connected to microsatellites and methods which were used in the experimental part of this thesis. The content of the experimental part was finding of polymorphic microsatellite loci. A number of one hundred and eighty seven primer pairs were tested by this method. For testing of these polymorphic microsatellite loci were used all published primers of Ciconiiformes, Grebe and Loon. On top of that a selection of microsatellite primers of Charadriiformes and Penguin. In order to prove the phylogenetic unrelated link some microsatellite primers of Anseriformes were also used. Following the detection of polymorphic loci was used the cross-species PCR amplification on six unrelated individuals of Abdim´s Stork. By the gradual testing were found twenty six polymorphous microsatellite loci for which were optimized both the temperature of annealing and the time of electrophoretic separation. The number of founded alleles was in within the range of two to six alleles per locus. In one sample of microsatellite loci was founded zero allel. The highest number of polymorphous loci was provided by microsatellite primer derived from wood stork (Mycteria americana) and white Stork (Ciconia ciconia).
Number of the records: 1