Diplomová práce se zabývá analýzou veřejných zakázek ve fakultních nemocnicích v České republice v době platnosti zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách. Teoretická část uvádí přehled vývoje legislativy a základní pojmy z této oblasti. Analytická část se zabývá rozborem dat získaných z webových stánek Informačního systému o veřejných zakázkách, z výročních zpráv fakultních nemocnic a ze zpráv o statistice veřejných zakázek za Českou republiku, předávaných Evropské komisi. Práce analyzuje vývoj trhu veřejných zakázek ve fakultních nemocnicích v letech 2006 - 2010. Vypočtené poměrové ukazatele vyjadřují rentabilitu nákladů, cenu veřejných zakázek na lůžko, index transparentnosti zadávání zakázek, podíl zrušených zakázek, poměr ceny veřejných zakázek k celkovým nákladům nemocnice a celkový zisk na jednu zakázku. Jejich prostřednictvím jsou nemocnice vzájemně porovnány. Získaná data jsou zpracována v tabulkách a grafech.This thesis deals with the public contract analysis at teaching hospitals in the Czech Republic at the time of validity of the Act No. 137/2006 Coll. on Public Contracts. The theoretical part provides an overview of legislative development and the basic terms of this area. The analytical part deals with analysis of data obtained from the web pages of the Information System on Public Contracts, from annual hospital reports and statistics reports on public contracts in the Czech Republic, sent to the European Commission. The thesis analyse the development of the public contract market at teaching hospitals in the years 2006 - 2010. Calculated ratio indicators reflect the cost-effectiveness, the cost of public contract per bed, the index of contract transparency, the rate of cancel contracts, the price rates of public contracts to total hospital costs, and the total profit per contract. These indicators then compare. teaching hospitals with each other. The acquired data is processed in tables and graphs.