Number of the records: 1
Vyhodnocení a validace proteomické analýzy mutantů Arabidopsis mpk4 a mpk6
Title statement Vyhodnocení a validace proteomické analýzy mutantů Arabidopsis mpk4 a mpk6 [rukopis] / Petra Kavalcová Additional Variant Titles Vyhodnocení a validace proteomické analýzy mutantů Arabidopsis mpk4 a mpk6 Personal name Kavalcová, Petra (dissertant) Translated title Evaluation and validation of proteomic analysis of Arabidopsis mutants mpk4 and mpk6 Issue data 2016 Note Ved. práce Tomáš Takáč Oponent Beáta Petrovská Another responsib. Takáč, Tomáš (thesis advisor) Petrovská, Beáta (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords MPK4 * MPK6 * mutanti * proteomika * bioinformatika * cytoskelet * antioxidační enzymy * auxin * MPK4 * MPK6 * mutants * proteomics * bioinformatics * cytoskeleton * antioxidant enzymes * auxin Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biochemie Degreee discipline Biotechnologie a genové inženýrství book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00193679-612989326.pdf 114 2.8 MB 22.04.2016 Posudek Typ posudku 00193679-ved-738281180.pdf Posudek vedoucího 00193679-opon-789829334.pdf Posudek oponenta Call number Barcode Location Sublocation Info DP-KBC/251 (PřF-KBO) 3134520332 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Mitogenem aktivované protein kinasy (MAPKs) jsou proteiny účastnící se přenosu extracelulárního signálu v Arabidopsis thaliana. MPK4 a MPK6 hrají důležitou roli v odpovědích na různé stresové podněty a ve vývojových procesech. Mnoho studií ukazuje přímou funkční spojitost MAPKs a cytoskeletu. Mutanti Arabidopsis mpk4 a mpk6 vykazují vývojové defekty, kterých molekulární podstata není přesně známa. Předkládaná diplomová práce má za cíl využít proteomickou analýzu mutantů mpk4 a mpk6 pro jejich bližší charakterizaci po molekulární stránce. Proteomickou analýzou jsme chtěli identifikovat možné proteiny, které se podílí na fenotypu mutantů. Zpracováním proteomických dat a jejich následnou validací pomocí imunoblotování, PHOSTAG technologie, detekcí specifické aktivity vybraných antioxidačních enzymů a sledováním kořenového fenotypu u obou mutantů po vlivu auxinu (auxinolu), jsme zjistili poškození aktinového cytoskeletu u obou mutantů a možnou regulaci MPK4 a MPK6 pomocí aktinového cytoskeletu. Zjistili jsme také rozdíly v abundanci antioxidačních enzymů mezi oběma mutanty a rozdílnou senzitivitu vůči exogenní aplikaci auxinu a auxinolu. Je možné konstatovat, že kombinace proteomické analýzy s biochemickými a fenotypovými analýzami nám pomohla detekovat možné nové funkce MPK4 a MPK6.Mitogen-activated protein kinases are proteins involved in the transmission of extracellular signals in Arabidopsis thaliana. MPK4 and MPK6 play an important role in responses to various stress stimuli and developmental processes. Many studies show a direct functional connection between MAPKs and cytoskeleton. Arabidopsis mpk4 and mpk6 mutants exhibit numerous developmental and physiological defects. Molecular regulation determining these defects are not exactly known. The present diploma thesis exploit differential proteomic analysis of mpk4 and mpk6 mutants for their better molecular characterization. We used shot-gun proteomic analysis to identify possible proteins that contribute to the phenotype and stress responses of the mutants. The differential proteomes of the mutants roots were evaluated by bioinformatic analysis and the proteins involved in development and antioxidant defence were validated using imunoblotting, specific activity staining on native PAGE gels as well as physiological examination of mutants response to auxin. Based on these data we found novel information about mpk4 and mpk6 mutants such as possibble disturbances of actin cytoskeleton and auxin response as well as different regulation of antioxidant defense.
Number of the records: 1