Number of the records: 1
Zpracovávání databázových informací o rostlinných superoxiddismutasach pomocí bioinformatických metod
Title statement Zpracovávání databázových informací o rostlinných superoxiddismutasach pomocí bioinformatických metod [rukopis] / Lucie Šimková Additional Variant Titles Zpracovávání databázových informací o rostlinných superoxiddismutasach pomocí bioinformatických metod Personal name Šimková, Lucie (dissertant) Translated title Processing of database informations about plant superoxide dismutases by using bioinformatics methods Issue data 2017 Phys.des. 53 s. (88 554 znaků vč. mezer) : il., schémata, tab. + 1 CD Note Ved. práce Marek Šebela Oponent Beáta Petrovská Another responsib. Šebela, Marek, 1971- (thesis advisor) Petrovská, Beáta (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords Superoxiddismutasa * MnSOD * bioinformatika * bioinformatické metody * proteinové sekvence * sekvenční přiřazení * fylogenetické stromy * modely proteinových terciárních struktur * Superoxid dismutase * MnSOD * bioinformatics * bioinformatic methods * protein sequences * sequence alignment * phylogenetic trees * models of protein tertiary structures Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biochemie Degreee discipline Bioinformatika book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00217070-859449337.pdf 62 3 MB 11.05.2017 Posudek Typ posudku 00217070-ved-850342924.pdf Posudek vedoucího 00217070-opon-959632228.pdf Posudek oponenta Call number Barcode Location Sublocation Info BP-KBC/211 (PřF-KBO) 3134520316 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Cílem této práce je získat co nejvíce databázových informací o rostlinných superoxiddismutasach, zejména o MnSOD, a tyto informace dále vhodně zpracovat. Práce je zaměřena konkrétně na aminokyselinové sekvence, jejich získání a další práci s nimi, jako je sekvenční přiřazení, tvorba fylogenetických stromů v programu MEGA6 a na závěr predikce sekundárních struktur webovou aplikací PSIPRED a terciárních struktur proteinu pomocí SWISS-MODEL. V úvodních kapitolách je obsažen teoretický vhled do řešeného problému, který umožňuje se zorientovat v dané problematice.The aim of this work is to get as much database informations as possible about plant superoxide dismutases, especially about MnSOD, and further elaborate these informations. This bachelor thesis focuses specifically on amino acid sequences, their acquisition and further work with them, such as sequence alignments, phylogenetic tree formation using the MEGA6 software and the prediction of secondary protein structures via PSIPRED and tertiary protein structures using SWISS-MODEL. The introductory chapters contain a theoretical insight into the problemation, which makes it easier to underestand given issue.
Number of the records: 1