Number of the records: 1  

Molekulární charakteristika Apple chlorotic leaf spot virus

  1. Title statementMolekulární charakteristika Apple chlorotic leaf spot virus [rukopis] / Veronika Ševčíková
    Additional Variant TitlesMolekulární charakteristika Apple chlorotic leaf spot virus
    Personal name Ševčíková, Veronika (dissertant)
    Translated titleMolecular characterization of Apple chlorotic leaf spot virus
    Issue data2016
    Phys.des.49 + 1 CD ROM
    NoteVed. práce Milan Navrátil
    Oponent Dana Šafářová
    Another responsib. Navrátil, Milan (thesis advisor)
    Šafářová, Dana (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Keywords Apple chlorotic leaf spot virus * Trichovirus * Rosaceae * ORF * genetická variabilita * Apple chlorotic leaf spot virus * Trichovirus * Rosaceae * ORF * genetic variability
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00203880-214453389.pdf391.1 MB05.05.2016
    PosudekTyp posudku
    00203880-ved-912548123.pdfPosudek vedoucího
    00203880-opon-810849449.pdfPosudek oponenta
    Call numberBarcodeLocationSublocationInfo
    BP-KBB/274 (PřF-KBO)3134520419PřF-HolicePřF, Knihovna Holice - skladIn-Library Use Only

    Bakalářská práce byla zaměřena na molekulární charakteristiku a genetickou variabilitu Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), jakožto celosvětově rozšířeného patogena ovocných jádrovin a peckovin. Teoretická část nejprve stručně shrnuje základní informace o ACLSV, charakterizuje rod Trichovirus a čeleď Betaflexiviridae, do kterých je ACLSV řazen. Teoretická část také popisuje geografické rozšíření viru. ACLSV byl detekován v oblastech zaměřených na pěstování ovocných dřevin, jeho rozšíření je téměř celosvětové. V práci jsou shrnuty biologické vlastnosti viru, mezi které řadíme hostitelský okruh viru, příznaky infekce, způsob přenosu a vliv infekce na výnos. ACLSV infikuje především rostliny z čeledi Rosaceae, a to jak planě rostoucí, tak pěstované druhy. Typickým příznakem infekce virem jsou chlorotické skvrny na listech, ale u mnoha druhů dřevin probíhá infekce latentní formou. Virus není přenášen na jiné rostliny pomocí pylu, semen ani žádným hmyzím vektorem. V práci jsou také popsány možné způsoby detekce viru a jeho molekulární charakteristika, především podrobnější je popis jednotlivých čtecích rámců ORF. Na závěr jsou uvedeny informace o doposud popsané genetické variabilitě izolátů ACLSV. Experimentální část bakalářské práce je zaměřena na stanovení celogenomické sekvence izolátů ACLSV získaných ze stromů Prunus domestica. Ze získaných PCR segmentů byla složena téměř úplná celogenomická sekvence českého izolátu 158. Fylogenetická analýza jednotlivých čtecích rámců testovaného izolátu potvrdila hostitelskou specifitu izolátu 158, ale také poměrně vysokou variabilitu ACLSV.The bachelor thesis is focused on the molecular characteristics and genetic variability of Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), as the worldwide distributed pathogen of pome and stone fruits. The theoretical part at first briefly summarizes basic information about ACLSV and characterizes genus Trichovirus and family Betaflexiviridae into which ACLSV is classified. The theoretical part also describes geographical distribution of the virus. ACLSV was detected in areas involving the cultivation of fruit trees, its distribution is nearly worldwide. It summarizes biological characteristics, such as the host range of the virus, symptoms of infection, mode of transmission and the impact of infection on yield. ACLSV infects especially plants of the family Rosaceae, both wild and cultivated species. Typical symptoms of virus infection are chlorotic spots on the leaves but the infection can be symptomless in many tree species. The virus is not transmissible to other plants by pollen, seeds or the insect vector. There are also described possible virus detection methods and the molecular characteristic, especially the description of the particular open reading frames ORF. In conclusion, there are provided information about genetic variability of isolates ALCSV mentioned before. The experimental part of this thesis is focused on determination of fullgenomic sequence of isolates ACLSV obtained from Prunus domestica. Almost complete fullgenomic sequence of the Czech isolate 158 was assembled from obtained PCR segments. Phylogenetic analysis of particular open reading frames of tested isolate confirmed host specifity of ACLSV isolates but also relatively high variability of ACLSV.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.