Number of the records: 1
Studium enzymů metabolizujících ornitin
Title statement Studium enzymů metabolizujících ornitin [rukopis] / Jan Tancer Additional Variant Titles Studium enzymů metabolizujících ornitin Personal name Tancer, Jan, (dissertant) Translated title Study of enzymes metabolizing ornithine Issue data 2023 Phys.des. 79 s Note Ved. práce David Kopečný Oponent Jan Frömmel Another responsib. Kopečný, David (thesis advisor) Frömmel, Jan (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords Acetylace * acetyltransferasa * enzym * ornitin * transaminasa * Acetylation * acetyl transferase * enzyme * ornithine * transaminase Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biochemie Degreee discipline Biochemie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00279169-330854428.pdf 8 2.3 MB 25.04.2023 Posudek Typ posudku 00279169-ved-389794129.pdf Posudek vedoucího 00279169-opon-265284646.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00279169-prubeh-762956262.pdf 14.10.2021 25.04.2023 23.05.2023 C Hodnocení známkou Ostatní přílohy Size Popis 00279169-other-575656331.pdf 138.3 KB
Acetylace je enzymaticky katalyzovaná reakce modulující širokou škálu molekulárně-biologických dějů. S acetylací je spojeno značné množství biomakromolekul i nízkomolekulárních sloučenin, jako například aminokyseliny či polyaminy. Tato diplomová práce je zaměřena na expresi rekombinantních enzymů N-acetylaminotransferasy (NATA) a ornitin-delta-aminotransferasy (OAT) z kukuřice seté (Zea mays) a následnou charakterizaci ZmOAT. NATA katalyzuje acetylaci aminoskupiny ornitinu v pozici N2, zatímco OAT katalyzuje transaminaci aminoskupiny v pozici N5, za vzniku glutamát-5-semialdehydu. Oba geny kódující ZmNATA a ZmOAT byly úspěšně klonovány a exprimovány v buňkách E. coli. Byla provedena optimalizace exprese rekombinantních proteinů, které byly následně vypurifikovány. Stabilita enzymu byla měřena pomocí nanodiferenciální skenovací fluorimetrie. U ZmOAT byla studována možnost přeměny N2-acetylornitinu na N2-acetylglutamát-5-semialdehyd. Vznik produktů reakce OAT s ornitinem byl potvrzen spřaženou reakcí s kukuřičnou glutamát-semialdehyddehydrogenasou (aldehyddehydrogenasou12, ZmALDH12). Byla provedena fylogenetická analýza rodiny OAT. S využitím technik molekulárního modelování byla studována možnost vazby acetylovaného substrátu v aktivním místě OAT.Acetylation is an enzymatically catalyzed reaction that modulates a wide range of molecular biological processes. A significant number of biomacromolecules and low molecular weight compounds, such as amino acids and polyamines, are associated with acetylation. This thesis focuses on the expression of the recombinant enzymes N-acetyl aminotransferase (NATA) and ornithine--aminotransferase (OAT) from maize (Zea mays) and the subsequent characterization of ZmOAT. NATA catalyzes the acetylation of the ornithine amino group at the N2 position, whereas OAT catalyzes the transamination of the amino group at the N5 position, to form glutamate-5-semialdehyde. Both genes encoding ZmNATA and ZmOAT were successfully cloned and expressed in E. coli cells. The expression of the recombinant proteins was optimized and they were subsequently purified. The stability of the enzymes was measured by nanodifferential scanning fluorimetry. The possibility of converting N2-acetylornithine to N2-acetylglutamate-5-semialdehyde was studied for ZmOAT. The formation of the OAT reaction products with ornithine was confirmed by coupled reaction with maize glutamate-semialdehyde dehydrogenase (aldehyde dehydrogenase12, ZmALDH12). A phylogenetic analysis of the OAT family was performed. The possibility of acetylated substrate binding in the active site of OAT was studied using molecular modeling techniques.
Number of the records: 1