Number of the records: 1
Technologie digitální polymerázové řetězové reakce (dPCR) a její využití v hematoonkologii
Title statement Technologie digitální polymerázové řetězové reakce (dPCR) a její využití v hematoonkologii [rukopis] / Andrea Štědrá Additional Variant Titles Technologie digitální polymerázové řetězové reakce (dPCR) a její využití v hematoonkologii Personal name Štědrá, Andrea, (dissertant) Translated title Digital polymerase chain reaction (dPCR) technology and its use in hematooncology Issue data 2022 Phys.des. 62 s. (115182 znaků) Note Oponent Helena Urbánková Ved. práce Jan Grohmann Another responsib. Urbánková, Helena, (opponent) Grohmann, Jan, (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords Chronická myeloidní leukémie * digitální PCR * inhibitory tyrosinkinas * imatinib * rezistence * Chronic myeloid leukemia * digital PCR * tyrosine kinase inhibitors * imatinib * resistance Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biochemie Degreee discipline Biochemie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00271397-520595825.pdf 14 1.6 MB 26.04.2022 Posudek Typ posudku 00271397-ved-704042714.pdf Posudek vedoucího 00271397-opon-970321604.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00271397-prubeh-934152934.pdf 19.10.2020 26.04.2022 23.05.2022 1 Hodnocení známkou
Diplomová práce se zaměřuje na problematiku detekce bodové mutace T315I v kinasové doméně fúzního genu BCR-ABL1 pomocí digitální PCR (dPCR) u pacientů s chronickou myeloidní leukémií (CML). CML se řadí do skupiny myeloproliferativních neoplázií s incidencí 1-2 případy na 100 000 obyvatel ročně. K léčbě jsou využívány inhibitory tyrosinkinas. U některých pacientů dochází k vývoji rezistence na léčbu. Jedním z důvodů je přítomnost mutací v kinasové doméně fúzního genu. Standardní metodou pro detekci mutací je Sangerovo sekvenování, které však není dostatečně senzitivní. Tento problém překonává dPCR, která je založena na rozdělení reakce do tisíců malých kompartmentů, v nichž probíhá PCR reakce samostatně. V rámci experimentální části byla optimalizována metoda dPCR pro detekci mutace T315I a následně vyšetřeno 28 vzorků ze souboru 14 pacientů. Bodová mutace T315I byla prokázána u 10/14 pacientů. Pomocí dPCR je možné detekovat přítomnost mutované alely v zastoupení až 0,01 %. Technologie dPCR má vyšší citlivost detekce než Sangerovo sekvenování.This diploma thesis focuses on the detection of the T315I point mutation in the kinase domain of the BCR-ABL1 fusion gene by digital PCR (dPCR) in patients with chronic myeloid leukemia (CML). CML belongs to the group of myeloproliferative neoplasms with an incidence of 1-2 cases per 100,000 population per year. Tyrosine kinase inhibitors are used for treatment. Some patients develop resistance to treatment. One of the reasons is the presence of mutations in the kinase domain of the fusion gene. The standard method for detecting mutations is Sanger sequencing, which is not sensitive enough. This problem is overcome by dPCR, which is based on the division of the reaction into several thousand small compartments, in which the PCR reaction takes place separately. In the experimental part, the dPCR method was optimized for the detection of the T315I mutation and subsequently 28 samples from a group of 14 patients were examined. The T315I point mutation was detected in 10/14 patients. Using dPCR, it is possible to detect the presence of a mutated allele in a proportion of up to 0.01 %. dPCR technology has a higher detection sensitivity than Sanger sequencing.
Number of the records: 1