Number of the records: 1
Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u pelikána skvrnozobého (Pelecanus philippensis)
Title statement Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u pelikána skvrnozobého (Pelecanus philippensis) [rukopis] / Monika Šuláková Additional Variant Titles Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u pelikána skvrnozobého (Pelecanus philippensis) Personal name Šuláková, Monika, (dissertant) Translated title Cross-species amplification of microsatellites from Sphenisciformes and conserved avian microsatellites in Spot-billed Pelican (Pelecanus philippensis) Issue data 2017 Phys.des. x s., 50 s. : il., grafy, tab. Note Ved. práce Petr Nádvorník Oponent Vladan Ondřej Another responsib. Nádvorník, Petr (thesis advisor) Ondřej, Vladan, 1975- (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra ekologie a životního prostředí (degree grantor) Keywords PCR amplifikace * cross-species * mikrosatelit * pelikán skvrnozobý * tučňák * PCR amplification * cross-species * microsatellite * Spot-billed pelican * penguin Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Ekologie a ochrana prostředí Degreee discipline Ekologie a ochrana životního prostředí book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00217761-337059510.pdf 125 1.2 MB 25.07.2017 Posudek Typ posudku 00217761-ved-721793128.pdf Posudek vedoucího 00217761-opon-959526817.doc Posudek oponenta Call number Barcode Location Sublocation Info BP-EKO/498 (PřF-KBO) 3134520672 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
V této bakalářské práci jsem se zabývala hledáním polymorfních mikrosatelitů u pelikána skvrnozobého (Pelecanus philippensis). V teoretické části jsem se věnovala taxonomickému zařazení pelikána skvrnozobého do systému ptáků, změnám, kterými tento systém v minulosti procházel a popsala jsem řád veslonozí (Pelecaniformes), čeleď pelikánovití (Pelecanidae), rod pelikán (Pelecanus) a následně biologii, ekologii a ochranu pelikána skvrnozobého. Dále jsem se zaměřila na možnosti využití molekulárních markerů v ekologii, popis repetitivní DNA s důrazem na mikrosatelity, jejich rozdělení a způsoby hledání mikrosatelitových lokusů. Poslední část rešerše jsem věnovala popisu hledání všech dosud objevených mikrosatelitů od druhů z řádu tučňáci, EST mikrosatelitů a konzervovaných ptačích mikrosatelitů. V praktické části jsem na genomické DNA šesti nepříbuzných jedinců pelikána skvrnozobého testovala cross-species PCR amplifikací celkem 173 párů primerů (113 párů primerů navržených pro 9 druhů tučňáků, 36 párů primerů pro amplifikaci 35 EST mikrosatelitů a 24 párů primerů pro amplifikaci konzervovaných ptačích mikrosatelitů). Všechny páry primerů poskytly u pelikána skvrnozobého polymorfní produkt, 14 z nich bylo polymorfních a u 6 nepříbuzných jedinců jsem nalezla 25 alel. Budoucím testováním na více jedincích bude možné zjistit populačně genetické charakteristiky těchto mikrosatelitů.In this bachelor thesis I was looking for polymorphic microsatellites in Spot-billed pelican (Pelecanus philippensis). In the theoretical part I dealt with taxonomic classification of Spot-billed pelican to the system of birds, changes by which it previously passed and I described order Pelecaniformes, family Pelecanidae and genus Pelican, followed by biology, ecology and conservation of Spot-billed pelican. I have also focused on the possibilities of using molecular markers in ecology, the description of repetitive DNA with emphasis on microsatellites, their distribution and ways of finding microsatellite loci. The last chapter of the teoretical part I descripted all microsatellites discovered from the penguins, EST microsatellites and CAM (Conserved Avian Microsatellites). In the practical part I tested on the genomic DNA of six unrelated individuals of Spot-billed pelican cross-species PCR amplification of a total number of 173 primer pairs (113 primer pairs designed for 9 penguin species, 36 primer pairs for amplification of 35 EST microsatellites and 24 primer pairs for amplification conserved avian microsatellites). All of the primer pairs amplified a polymorphic product, 14 of them were polymorphic, and I found in 6 unrelated individuals 25 alleles. Future tests on higher number of the individuals will determine the population genetic characteristics of these microsatellites.
Number of the records: 1