Number of the records: 1
Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u nesyta indomalajského (Mycteria leucocephala)
Title statement Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u nesyta indomalajského (Mycteria leucocephala) [rukopis] / Alexandra Pechová Additional Variant Titles Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u nesyta indomalajského (Mycteria leucocephala) Personal name Pechová, Alexandra (dissertant) Translated title Cross-species amplification of microsatellites from Sphenisciformes and conserved avian microsatellites in painted stork (Mycteria leucocephala) Issue data 2014 Phys.des. 54 Note Ved. práce Petr Nádvorník Another responsib. Nádvorník, Petr (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra botaniky (degree grantor) Keywords cross-species PCR amplifikácia * Mycteria leucocephala * mikrosatelitový lokus * polymorfizmus * cross.species PCR amplification * Mycteria leucocephala * microsatellite loc * polymorphism Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language slovenština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biologie Degreee discipline Biologie - Geologie a ochrana životního prostředí book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00190263-659517843.pdf 54 458.8 KB 25.07.2014 Posudek Typ posudku 00190263-ved-308238800.doc Posudek vedoucího 00190263-opon-204249248.doc Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00190263-prubeh-358843775.pdf 13.11.2013 25.07.2014 27.08.2014 1 Hodnocení známkou Call number Barcode Location Sublocation Info BP-BOT/100 (PřF-KBO) 3134517514 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
V tejto bakalárskej práci som sa venovala hľadaniu nových polymorfných mikrosatelitových márkerov pre myktériu lysohlavú (Mycteria leucocephala) za využitia metódy cross-species PCR amplifikácie. V teoretickej časti som sa zaoberala podrobným opisom radu brodivcov (Ciconiiformes) a jeho piatim čeľadiam. Podrobnejšie som sa venovala opisu čeľadi bocianovitých kam patrí aj myktéria lysohlavá. Ako ďalšiemu som sa venovala teoretickému spracovaniu repetitívnej DNA z doposiaľ známych literárnych zdrojov. Väčšiu pozornosť som venovala opisu mikrosatelitov, ich deleniu, využitiu, mutáciam, navrhovaniu de novo a cross-species PCR amplifikácii. V poslednej časti som sa venovala popisu doposiaľ nájdeným polymorfným mikrosatelitovým lokusom u radu tučniakov, brodivcov, potápiek, konzervovaným vtáčím mikrosatelitom, EST mikrosatelitom a metódam ich vyhľadávania. V experimentálnej časti tejto bakalárskej práce som sa zaoberala vyhľadávaním polymorfných mikrosatelitových lokusov s využitím metódy cross-species PCR amplifikácie na genomickej DNA vyizolovanej zo 6 jedincov myktérie lysohlavej. Za týmto účelom som použila všetky doposiaľ známe mikrosatelity navrhnuté pre rad tučniaky, niekoľko mikrosatelitov z radu brodivce a potápky, EST mikrosatelity a konzervované vtáčie mikrosatelity. Experimentálnymi metódami som zistila u myktérie lysohlavej 17 nezávyslých polymorfných mikrosatelitov z testovaných 169 párov primerov. Z toho bolo 5 mikrosatelitov odvodených z radu tučniaky, 4 mikrosatelity odvodene z radu brodivce a 1 mikrosatelit odvodený od radu potápky. Z konzervovaných vtáčích mikrosatelitov vykazovali polymorfizmus 3 mikrosatelity a 1 mikrosatelit z EST sekvencií. Počet alel sa pohyboval od 2 do 5.I dedicated this thesis to a search of new polymorphic microsatellite markers for painted stork (Mycteria leucocephala), using the method of cross-species PCR amplification. In the theoretical part I dealt with a detailed description of a Ciconiiformes and its five families. More detailed, I described the stork family that includes also painted stork. Furthermore, I dealt with theoretical elaboration of repetitive DNA using literary sources known so far. I paid more attention to the description of microsatellites, their division, utilization, mutations and proposition of de novo and cross-species PCR amplification. In the last part, I described polymorphic microsatellite loci founded so far within the order of Sphenisciformes, Ciconiiformes, Podicipediformes, conserved avian microsatellites, EST microsatellites and their search methods. In the experimental part of the thesis, I dealt with a search of polymorphic microsatellite loci, using the method of cross-species PCR amplification on isolated genomic DNA from 6 painted storks. For this purpose I used all know microsatellites proposed for the order of Sphenisciformes, few microsatellites from the order of Ciconiiformes and Podicipediformes, EST microsatellites and conserved avian microsatellites. Using the experimental methods I found 17 independent polymorphic microsatellite loci out of the original 169 pairs of primers for painted stork. Five microsatellites were derived from the order of Sphenisciformes, 4 from the order of Ciconiiformes and 1 from the order of Podicipediformes. Three conserved avian microsatellites showed polymorphism and one was with EST sequence. The number of alleles varied from 2 to 5.
Number of the records: 1