Number of the records: 1  

Analýza vybraných polymorfných cross-species mikrosatelitov pre determináciu paternity u takatry tmavej (Scopus umbretta)

  1. Title statementAnalýza vybraných polymorfných cross-species mikrosatelitov pre determináciu paternity u takatry tmavej (Scopus umbretta) [rukopis] / Andrea Sláviková
    Additional Variant TitlesAnalýza vybraných polymorfných cross - species mikrosatelitov pre determináciu paternity u takatry tmavej (Scopus umbretta)
    Personal name Sláviková, Andrea (dissertant)
    Translated titleThe analysis of selected polymorphic cross-species microsatellites for determination of paternity in Hammerkop (Scopus umbretta)
    Issue data2012
    Phys.des.67
    NoteVed. práce Petr Nádvorník
    Oponent Miloslav Kitner
    Another responsib. Nádvorník, Petr (thesis advisor)
    Kitner, Miloslav (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Keywords mikrosatelity * polymorfizmus * takatra tmavá * cross-species PCR amplifikácia * microsatellites * polymorphism * Hammerkop * cross-species PCR amplification
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languageslovenština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00158515-160543156.pdf301.8 MB26.07.2012
    PosudekTyp posudku
    00158515-ved-261028951.pdfPosudek vedoucího
    00158515-opon-847310393.pdfPosudek oponenta
    Call numberBarcodeLocationSublocationInfo
    BP-KBB/157 (PřF-KBO)3134513641PřF-HolicePřF, Knihovna Holice - skladIn-Library Use Only

    Táto bakalárska práca sa zameriava na hľadanie polymorfných mikrosatelitov u druhu takatra tmavá, ktoré budú ďalej využité k určeniu paternity u tohto druhu. Metódou cross-species PCR amplifikácie som otestovala všetkých 386 mikrosatelitov, ktoré sú známe od príbuzných radov: veslonožce, brodivce, plameniaky, potáplice, potápky a takisto som testovala aj niektoré mikrosatelity od nepríbuzných radov, konkrétne tučniaky, zúbkozobce a bahniaky. Teoretická časť obsahuje informácie o typoch repetícií so zameraním na mikrosatelity, ich vznik, vývoj a využitie. V praktickej časti som analyzovala všetky mikrosatelity. Celkovo som našla 23 polymorfných mikrosatelitov s počtom aliel v rozmedzí od 2 do 5. Priemerný počet aliel na lokus je 2,43. Zo všetkých primerov sa najlepšie amplifikovali práve mikrosatelity z radov Pelecaniformes a Ciconiiformes. Z údajov, ktoré som získala v praktickej časti je podľa tradičného systému takatra priama príbuzná s radom veslonožce a podľa amplifikovaných polymorfných mikrosatelitov je vzdialenejšia príbuzná s brodivcami a plameniakmi. Podľa nového systému je takatra bližšia príbuzná s pelikánmi a veslonožcami, vzdialenejšia príbuzná s bocianmi, brodivcami a plameniakmi a veľmi vzdialená príbuzná z faetónmi.This bachelor thesis is focused to find polymorphic microsatellites in Hamerkop, which will use in determination of paternity in this species. Using cross-species PCR amplification I tested all primers known in releated orders of birds: Pelecaniformes, Ciconiiformes, Phoenicopteriformes, Gaviiformes and Podici-pediformes, and similarly I tested several microsatellites from unreleated orders Sphenisciformes, Anseriformes and Charadriiformes. The theoretical section contains information about the types of repeats focused on microsatellites, their origin, development and utilization. In the practical part I analysed all microsatellites. Generally, I found 23 polymorphic microsatellites and their number of alleles ranged from 2 to 5. The average number of alleles per locus is 2.43. From all of primers the best amplified microsatellites are from Pelecaniformes and Ciconiiformes. The data that I obtained in the practical part suggest that Hamerkop is direct relative of order Pelecaniformes and also by amplified polymorphic microsatellites is close relative of Ciconiiformes and Phoenicopteriformes in traditional system. According to the new system is Hamerkop relative of order Pelecaniformes and Phalacrocoraciformes, distant relative of Ciconiiformes, Ardeiformes and Phoenicopteriformes and very distant relative of Phaethontiformes.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.