Number of the records: 1
Analýza vybraných polymorfných cross-species mikrosatelitov pre determináciu paternity u takatry tmavej (Scopus umbretta)
Title statement Analýza vybraných polymorfných cross-species mikrosatelitov pre determináciu paternity u takatry tmavej (Scopus umbretta) [rukopis] / Andrea Sláviková Additional Variant Titles Analýza vybraných polymorfných cross - species mikrosatelitov pre determináciu paternity u takatry tmavej (Scopus umbretta) Personal name Sláviková, Andrea (dissertant) Translated title The analysis of selected polymorphic cross-species microsatellites for determination of paternity in Hammerkop (Scopus umbretta) Issue data 2012 Phys.des. 67 Note Ved. práce Petr Nádvorník Oponent Miloslav Kitner Another responsib. Nádvorník, Petr (thesis advisor) Kitner, Miloslav (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords mikrosatelity * polymorfizmus * takatra tmavá * cross-species PCR amplifikácia * microsatellites * polymorphism * Hammerkop * cross-species PCR amplification Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language slovenština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00158515-160543156.pdf 30 1.8 MB 26.07.2012 Posudek Typ posudku 00158515-ved-261028951.pdf Posudek vedoucího 00158515-opon-847310393.pdf Posudek oponenta Call number Barcode Location Sublocation Info BP-KBB/157 (PřF-KBO) 3134513641 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Táto bakalárska práca sa zameriava na hľadanie polymorfných mikrosatelitov u druhu takatra tmavá, ktoré budú ďalej využité k určeniu paternity u tohto druhu. Metódou cross-species PCR amplifikácie som otestovala všetkých 386 mikrosatelitov, ktoré sú známe od príbuzných radov: veslonožce, brodivce, plameniaky, potáplice, potápky a takisto som testovala aj niektoré mikrosatelity od nepríbuzných radov, konkrétne tučniaky, zúbkozobce a bahniaky. Teoretická časť obsahuje informácie o typoch repetícií so zameraním na mikrosatelity, ich vznik, vývoj a využitie. V praktickej časti som analyzovala všetky mikrosatelity. Celkovo som našla 23 polymorfných mikrosatelitov s počtom aliel v rozmedzí od 2 do 5. Priemerný počet aliel na lokus je 2,43. Zo všetkých primerov sa najlepšie amplifikovali práve mikrosatelity z radov Pelecaniformes a Ciconiiformes. Z údajov, ktoré som získala v praktickej časti je podľa tradičného systému takatra priama príbuzná s radom veslonožce a podľa amplifikovaných polymorfných mikrosatelitov je vzdialenejšia príbuzná s brodivcami a plameniakmi. Podľa nového systému je takatra bližšia príbuzná s pelikánmi a veslonožcami, vzdialenejšia príbuzná s bocianmi, brodivcami a plameniakmi a veľmi vzdialená príbuzná z faetónmi.This bachelor thesis is focused to find polymorphic microsatellites in Hamerkop, which will use in determination of paternity in this species. Using cross-species PCR amplification I tested all primers known in releated orders of birds: Pelecaniformes, Ciconiiformes, Phoenicopteriformes, Gaviiformes and Podici-pediformes, and similarly I tested several microsatellites from unreleated orders Sphenisciformes, Anseriformes and Charadriiformes. The theoretical section contains information about the types of repeats focused on microsatellites, their origin, development and utilization. In the practical part I analysed all microsatellites. Generally, I found 23 polymorphic microsatellites and their number of alleles ranged from 2 to 5. The average number of alleles per locus is 2.43. From all of primers the best amplified microsatellites are from Pelecaniformes and Ciconiiformes. The data that I obtained in the practical part suggest that Hamerkop is direct relative of order Pelecaniformes and also by amplified polymorphic microsatellites is close relative of Ciconiiformes and Phoenicopteriformes in traditional system. According to the new system is Hamerkop relative of order Pelecaniformes and Phalacrocoraciformes, distant relative of Ciconiiformes, Ardeiformes and Phoenicopteriformes and very distant relative of Phaethontiformes.
Number of the records: 1