Diplomová práce se zabývá vývojem metody pro separaci a charakterizaci různých forem sulfatovaných -cyklodextrinů pomocí kapilární elektroforézy. Zároveň zkoumá rozdíly ve složení několika vybraných šarží sulfatovaného -cyklodextrinu od různých výrobců, k čemuž bylo použito několik metod. V praktické části je popsána optimalizace metod, které byly použity pro charakterizaci sulfatovaných cyklodextrinů. Nejprve byly sulfatované -cyklodextriny přímo separovány pomocí kapilární elektroforézy s vodivostní detekcí. Následně byla pro jejich charakterizaci použita chirální separace s UV/VIS detekcí, ve které figurovaly jako chirální selektory. Na závěr byla pro jejich analýzu použita metoda CE-ESI-MS.The Master's thesis is focused on the development of method for separation and characterization of various forms of sulphated -cyclodextrins using capillary electrophoresis. It also examines the differences in the content of their forms in selected batches from different manufacturers. The practical part describes the optimalization of methods that were used for the characterization. Firstly, sulphated cyclodextrins were directly separated by capillary electrophoresis with conductivity detector. Subsequently, they were used as chiral selectors for chiral separation with UV/VIS detection, and finally the CE-ESI-MS method was used for their analysis.