Number of the records: 1  

Analýza transkriptomu v průběhu vývoje embrya Sorghum purpureosericeum

  1. Title statementAnalýza transkriptomu v průběhu vývoje embrya Sorghum purpureosericeum [rukopis] / Tereza Bojdová
    Additional Variant TitlesAnalýza transkriptomu v průběhu vývoje embrya Sorghum purpureosericeum
    Personal name Bojdová, Tereza, (dissertant)
    Translated titleTranscriptome analysis of developing embryo of Sorghum purpureosericeum
    Issue data2023
    Phys.des.75 : tab.
    NoteVed. práce Jan Bartoš
    Oponent Radim Čegan
    Another responsib. Bartoš, Jan (thesis advisor)
    Čegan, Radim, (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého v Olomouci. Přírodovědecká fakulta. Katedra biotechnologií (degree grantor)
    Keywords Sorghum purpureosericeum * B chromozómy * eliminace B chromozómů * transkriptomika * Sorghum purpureosericeum * B chromosomes * B chromosome elimination * transkriptomics
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programBiotechnologie a genové inženýrství
    Degreee disciplineBiotechnologie a genové inženýrství
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00282681-233993996.pdf02.2 MB02.05.2023
    PosudekTyp posudku
    00282681-ved-139691556.pdfPosudek vedoucího
    00282681-opon-767984204.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00282681-prubeh-970905798.pdf30.09.202102.05.202330.05.2023AHodnocení známkou

    Divoký druh čiroku Sorghum purpureosericeum může nad rámec své chromozomální sady obsahovat také nadbytečné B chromozómy, což jsou postradatelné elementy, které svým hostitelským organismům zpravidla neposkytují žádnou výhodu. B chromozómy S. purpureosericeum nejsou stabilní ve všech pletivech a během brzkého embryonálního vývoje dochází k jejich eliminaci ze všech pletiv kromě nediferenciovaných meristémů nadzemních orgánů. Cílem této práce bylo vytvoření referenční genomové sekvence S. purpureosericeum a transkriptomická analýza RNA-Seq dat embryí v různém stádiu vývoje za účelem selekce kandidátních genů, které jsou odlišně exprimovány a mohly by být zodpovědné za eliminaci B chromozómů.The wild species Sorghum purpureosericeum can contain supernumerary B chromosomes in addition to its normal chromosomal set. B chromosomes are dispensable elements that typically provide no advantage to their host organisms. B chromosomes of S. purpureosericeum are not stable and are eliminated from all tissues except apical meristem during early embryonic development. The aim of this study was to create a reference genome sequence of S. purpureosericeum and perform transcriptomic analysis of RNA-Seq data from embryos at different stages of development in order to identify candidate genes that are differentially expressed and could be responsible for B chromosome elimination.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.