Number of the records: 1
Identifikácia chromozomálnych prestavieb v rodu Musa spp. s využitím Oxford Nanopore sekvencií
Title statement Identifikácia chromozomálnych prestavieb v rodu Musa spp. s využitím Oxford Nanopore sekvencií [rukopis] / Simona Martikánová Additional Variant Titles Identifikace chromozomálních přestaveb v rodu Musa spp. s využitím Oxford Nanopore sekvencí Personal name Martikánová, Simona, (dissertant) Translated title Identification of chromosomal rearrangements in Musa spp. using Oxford Nanopore sequencing Issue data 2023 Phys.des. 71 : tab. Note Ved. práce Eva Hřibová Oponent Zuzana Tulpová Another responsib. Hřibová, Eva (thesis advisor) Tulpová, Zuzana (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords Banánovník * translokácia * Oxford Nanopore sekvenovanie * chromozómy * genóm * Banana tree * translocation * Oxford Nanopore sequencing * chromosomes * genome Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language slovenština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Bioinformatika Degreee discipline Bioinformatika book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00279171-595535670.pdf 27 6.8 MB 16.05.2023 Posudek Typ posudku 00279171-ved-209474400.pdf Posudek vedoucího 00279171-opon-199908737.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00279171-prubeh-370403806.pdf 14.10.2021 16.05.2023 14.06.2023 B Hodnocení známkou Ostatní přílohy Size Popis 00279171-other-367912935.zip 1.3 MB
Banánovník (Musa spp.) je rod bylín z čeľade Musaceae. Najdôležitejšie typy jedlých banánov pochádzajú z hybridizácie dvoch druhov: Musa acuminata a Musa balbisiana. Pozorovanie nepravidelností párovania chromozómov v meióze hybridov medzi týmito poddruhmi naznačovalo prítomnosť veľkých chromozomálnych štrukturálnych prestavieb, hlavne translokácií. Nanopórové sekvenovanie je prístup tretej generácie, ktorý umožňuje získanie DNA alebo RNA sekvencií. V tejto práci sme sa zamerali na použitie čítaní získaných s metódou Oxford Nanopore pre genóm banánovníka pre identifikáciu veľkých chromozomálnych translokácií a ich vizualizáciu.Banana (Musa spp.) is a genus of herbs from the Musaceae family. The most important types of edible bananas come from the hybridization of two species: Musa acuminata and Musa balbisiana. Observation of chromosome pairing irregularities in meiosis of hybrids between these subspecies indicated the presence of large chromosomal structural rearrangements, mainly translocations. Nanopore sequencing is a third-generation approach that allows obtaining DNA or RNA sequences. In this work, we focused on using the Oxford Nanopore reads for the banana genome for a large number of chromosomal translocations and their visualization.
Number of the records: 1