Number of the records: 1
Studium genové exprese genů vybraných aldehyddehydrogenas v kukuřici a mechu
Title statement Studium genové exprese genů vybraných aldehyddehydrogenas v kukuřici a mechu [rukopis] / Jakub Bělíček Additional Variant Titles Studium genové exprese genů vybraných aldehyddehydrogenas v kukuřici a mechu Personal name Bělíček, Jakub, (dissertant) Translated title Study of gene expression of selected aldehyde dehydrogenases in maize and moss Issue data 2019 Phys.des. 60 s. (83 168 znaků) : grafy, schémata, tab. Note Oponent David Zalabák Ved. práce Radka Končitíková Another responsib. Zalabák, David (opponent) Končitíková, Radka (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords Aldehyddehydrogenasa * genová exprese * abiotický stres * Physcomitrella patens * Zea mays * qRT-PCR * fylogenetická analýza * Aldehyde dehydrogenase * gene expression * abiotic stress * Physcomitrella patens * Zea mays * qRT-PCR * phylogenetic analysis Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biochemie Degreee discipline Biochemie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00234277-945579233.pdf 92 1.9 MB 13.05.2019 Posudek Typ posudku 00234277-ved-911118242.pdf Posudek vedoucího 00234277-opon-754691600.pdf Posudek oponenta
Tato bakalářská práce se zabývá vlivem abiotického stresu na změnu genové exprese genů aldehyddehodrogenas u kukuřice (Zea mays) a mechu (Physcomitrella patens) s využitím kvantitativních PCR experimentů v kombinaci s reverzní transkripcí RNA (qRT-PCR). Izolovaná RNA byla purifikována a transkribována do cDNA, jež sloužila jako základ pro qPCR experimenty. Pro detekci amplifikace byly použity FAM-TAMRA sondy. Naměřené hodnoty cyklu prahu (CT) byly přepočítány na počet kopií genů vztažený na ng RNA. Byla rovněž provedena fylogenetická analýza enzymů aldehyddehydrogenas v kukuřici a mechu. Stres vyvolaný přídavkem soli zapříčinil zvýšení exprese u genů PpALDH7 a PpALDH10, dále potom u ZmALDH7 a ZmALDH12 v kombinaci s přídavkem aminokyselin a všech ZmAMDH v kombinaci s přídavkem putrescinu. Tyto enzymy pravděpodobně v rostlinách zodpovídají za adaptaci na zvýšenou koncentraci solí v půdním roztoku. Vlivem dehydratace pak došlo k zesílení exprese u PpALDH2A, PpALDH10 a PpALDH21, což poukazuje na jejich osmoprotektivní roli. Dehydratace naopak vyvolala snížení exprese u PpALDH2B.This bacherol thesis deals with the effect of abiotic stress on difference in gene expresssion of aldehyde dehydrogenases genes in maize (Zea mays) and moss (Physcomitrella patens) using PCR experiments with the combination of reverse transcription of RNA (qRT-PCR). Isolated RNA was purified and transcribed into cDNA, the basis for qPCR assay. FAM-TAMRA probes were used for detection of amplification. The measured cycle treshold (CT) values were converted to the number of gene copies relative to ng of RNA. The phylogenetic analysis of aldehyde dehydrogenases genes in maize and moss was solved too. Salt addition-induced stress caused increase of expression of PpALDH7 and PpALDH10, followed by ZmALDH7 and ZmALDH12 in combination with addition of amino acids and all ZmAMDHs in combination with putrescine addition. The enzymes are likely to be responsible for salt-caused stress adaptation in these plants. Dehydratation-caused stress upregulated expression of PpALDH2A, PpALDH10 and PpALDH21, suggesting their osmoprotective role. Conversely, dehydratation-caused stress induced a decrease of expression of PpALDH2B.
Number of the records: 1