Number of the records: 1  

Simulace Cytochrom P450 reduktázy

  1. Title statementSimulace Cytochrom P450 reduktázy [rukopis] / Martin Šrejber
    Additional Variant TitlesSimulace Cytochrom P450 reduktázy
    Personal name Šrejber, Martin (dissertant)
    Translated titleSimulation of Cytochrome P450 reductase
    Issue data2016
    Phys.des.64 : il., grafy, schémata + 1 CD ROM
    NoteOponent Michal Otyepka
    Ved. práce Karel Berka
    Another responsib. Otyepka, Michal, 1975- (opponent)
    Berka, Karel, 1982- (thesis advisor)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (degree grantor)
    Keywords cytochrom P450 reduktáza * molekulárně dynamické simulace * metadynamické simulace * elektronový transport * cytochrome P450 reductase * molecular dynamics simulations * metadynamics simulations * electron transport
    Form, Genre diplomové práce master's theses
    UDC (043)378.2
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleMgr.
    Degree programNavazující
    Degree programChemie
    Degreee disciplineFyzikální chemie
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00194013-199749747.pdf545.1 MB03.05.2016
    PosudekTyp posudku
    00194013-ved-672677323.docxPosudek vedoucího
    00194013-opon-183810924.docxPosudek oponenta

    Cytochrom P450 reduktáza (CPR) je klíčovým proteinem mikrosomálních elektronových transportů. Na cytosolární straně endoplazmatického retikula tvoří CPR komplexy s řadou redoxních partnerů a zprostředkovává zde elektronový transport. Tímto je nepřímo zapojen do procesu biodegradace látek xenobiotického a endobiotického původu. V krystalech se CPR vyskytuje buď v uzavřené, nebo v otevřené konformaci, přičemž jejich přechod je spojen s rozsáhlou konformační změnou struktury proteinu. V této práci byly simulovány různé konformace CRP spolu s konformační změnou, kterou protein podstupuje. Dále byl popsán proces přenosu redukčního ekvivalentu mezi plně redukovanou formou kofaktoru NADPH a kofaktorem FAD. Závěrem byl připraven a simulován model komplexu CPR s redoxním partnerem cytochromem P450 3A4 ukotvených na fosfatidylcholinové membráně.Cytochrome P450 reductase (CPR) plays key role in microsomal electron transport chains. CPR binds all variety of redox partners on the cytosolic side of endoplasmic reticulum. By this, CPR in indirectly involved in processes of biodegradation of compounds of xenobiotic and endobiotic origin. CPR crystal structures can be found in close and open conformation while their transition lead to great conformational changes in protein structure. Here, we performed simulations of CPR in different conformation along with simulation of protein conformation changes. In addition, we describe the process of transfer of reduction equivalent between fully reduced form of NADPH cofactor and FAD cofactor. Finally, we created and simulated model of complex of CPR with its redox partner cytochrome P450 3A4 on phosphatidylcholine membrane.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.