Number of the records: 1
Testování teplotní uniformity termocyklérů pomocí analýzy teploty tání stejného amplikonu
Title statement Testování teplotní uniformity termocyklérů pomocí analýzy teploty tání stejného amplikonu [rukopis] / Eva Hrušková Additional Variant Titles Testování teplotní uniformity termocyklérů pomocí analýzy teploty tání stejného amplikonu Personal name Hrušková, Eva (dissertant) Translated title Testing the temperature uniformity of the thermocyclers using melting temperature of the same amplicon Issue data 2015 Phys.des. 80 : il., grafy, tab. Note Ved. práce Jiří Drábek Oponent Jana Stránská Another responsib. Drábek, Jiří, 1969- (thesis advisor) Stránská, Jana (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords variabilita * akreditace * kalibrace * kalibrační souprava * PCR * variability * acreditation * calibration * calibration kit * PCR Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00187077-457578682.pdf 31 3.2 MB 22.04.2015 Posudek Typ posudku 00187077-ved-415515241.pdf Posudek vedoucího 00187077-opon-610479847.pdf Posudek oponenta Call number Barcode Location Sublocation Info DP-KBB/142 (PřF-KBO) 3134516895 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Kvantitativní polymerázová řetězová reakce v reálném čase (qPCR) patří k nejčastějším metodám užívaným v biologickém výzkumu. Všechny výzkumné oblasti jako medicína, veterinářství, forenzní výzkum, potravinářství a další jsou dnes na této metodě závislé. Obecně je PCR založena na cyklických změnách teploty, proto jsou na teplotní uniformitu termocykléru, přesnost a správnost výsledků kladeny přísné požadavky. Pro zaručení správné funce a splnění akreditačních požadavků laboratoře (ISO 15189, ISO 17025) je nutno termocykléry pravidelně kalibrovat akreditovanými kalibračními laboratořemi. Ty však často nejsou vybaveny pro kalibraci termocyklérů s uzavřenou konstrukcí jako v případě LightCycler 480 II nebo Rotor-Gene 3000TM, proto je třeba vyhledat jinou metodu. Teoretická část této diplomové práce je zaměřena na zdůvodnění důležitosti kalibrace termocyklérů a přehled dostupných kalibračních metod. V praktické části je porovnávána teplota tání (Tm) stejné amplifikované sekvence DNA v termocyklérech dostupných v Laboratoři experimentální medicíny Ústavu molekulární a translační medicíny, Lékařské fakulty Univerzity Palackého v Olomouci. Dále je hodnoceno, zda uniformita těchto přístrojů odpovídá parametrům deklarovaným výrobcem a parametrům vyžadovaným dle akreditace. Součástí této části je vytváření prototypu přenosné soupravy pro kalibraci termocyklérů typu LightCycler.The quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) is one of the most common methods used in biological research. All fields of research like medicine, veterinary, forensic research, the food industry and others, depend on this method these days. In general, PCR is based on the temperature changes, co the defined requirements are set on the temperature uniformity of thermocyclers, precision and accuracy of results. To assure the proper function and to fulfill acreditation requirements of laboratory (ISO 15189, ISO 17025), it is necessary to calibrate thermocyclers regularly by accredited calibration laboratories. However, they are sometimes not equipped for the calibration of closed construction thermocyclers like LightCycler 480 II or Rotor-Gene 3000TM, so the different method has to be find. The theoretical part of the diploma thesis is focused on the justifying of the thermocyclers calibration importance and summary of the available calibration methods. Within the practical part, the melting temperature (Tm) of the same amplified sequence in thermocyclers present in the Laboratory of Experimental Medicine, Institute of Molecular and Translational Medicine, Faculty of Medicine and Dentistry, Palacky University Olomouc is compared. Furthermore, the parameters declared by the manufacturers and the fulfilment of acreditation requirements for the temperature block uniformity are evaluated. One part of this thesis concerns development of the portable calibration kit for calibration of LightCycler-typed thermocyclers.
Number of the records: 1