Parkinsonova choroba, popřípadě parkinsonismus, je druhé nejčastější neurodegenerativní onemocnění, které postihuje asi 1,5 % populace nad 65 let a jeho prevalence narůstá s věkem. Parkinsonova choroba byla poprvé popsána v 19. století. U pacientů dochází k progresivní ztrátě dopaminergních neuronů v substantia nigra ve středním mozku a tvorbě Lewyho tělísek. Převážná většina případů je sporadických, nicméně 5 - 10 % představuje familiární formu ať už s autozomálně dominantní, nebo recesivní dědičností. V souvislosti s familiární formou bylo popsáno celkem 23 tzv. PARK genů s číslem pořadí, v jakém byly popsány v asociaci s tímto onemocněním. V rámci naší předchozí epidemiologické studie byla popsána 3x - 4x vyšší prevalence tohoto onemocnění u izolované populace v oblasti jihovýchodní Moravy, tzv. Horňácka. První část naší studie se týkala cíleného NGS sekvenování. Cílem bylo ze získaných dat posoudit potenciálně genetické rizikové faktory haplotypů v genech asociovaných s parkinsonismem u pacientů a kontrol z Horňácka. V naší studii jsme nalezli společný výskyt 5 variant (4 intronových a 1 exonové) v genu LRRK2 u 6 pacientů a žádné z kontrol (C1). Pro získání větší kontrolní skupiny jsme použili data z celogenomového sekvenování 100 zdravých nepříbuzných jedinců z České republiky (C2) a dostupná data z projektu 1000 Genomes Project (C3). Dále byla posuzována frekvence daného haplotypu u pacientů a u těchto 3 kontrolních skupin, kde mezi pacienty a kontrolními skupinami C1 a C3 byly nalezeny statisticky významné rozdíly (C1, p = 0,0031; C3, p < 0,0001). U pacientů a kontrolní skupiny C2 byla frekvence haplotypu, i vzhledem k nižšímu počtu pacientů, pouze na hranici statistické významnosti (p = 0,11). Další část naší studie byla zaměřená na celoexomové sekvenování (WES), kdy cílem bylo vybrat vhodná tria ze sestaveného rodokmenu horňácké populace, provést WES a vyhodnotit získaná data pomocí dvou různých nezávislých softwarů (Ion Reporter a Ingenuity Variant Analysis). Dále pak posoudit a vyhodnotit nalezené varianty přítomné pouze u pacientů v rámci jednotlivých trií. V této studii nebyla nalezena žádná patogenní varianta děděná napříč celým rodokmenem (founder). Naopak jsme nalezli několik variant, které byly sdíleny mezi jednotlivými trii. Jako nejvíce zajímavou hodnotíme velmi vzácnou variantu v genu pro monoaminový transporter (SLC18A2), která podle všech predikčních nástojů byla vyhodnocena jako poškozující. Výsledky naší studie zaměřené na odhalení genetického pozadí parkinsonismu u izolované populace v oblasti Horňácka naznačují, že by se mohlo jednat o kumulaci vícero rizikových genetických faktorů.Parkinson's disease, or parkinsonism, is the second most frequent neurodegenerative disease that affects about 1.5 % of the population over the age of 65 and its prevalence increases with age. Parkinson's disease was first described in the 19th century. In patients, progressive loss of dopaminergic neurons occurs in substantia nigra in midbrain and Lewy bodies form. Most of the cases is sporadic, however, 5 - 10 % represent familial form either with autosomal dominant or recessive inheritance. In connection with familial form the total of 23 so called PARK genes with number - order of their description - have been described. Within our previous epidemiological study, 3 - 4 times higher prevalence of the disease was described in isolated population in the region of southeast Moravia, so called Horňácko. The first part of our study concerned targeted NGS sequencing. The aim was to assess, based on obtained data, potential genetic risk factors of haplotypes in genes associated with parkinsonism in patients and controls from Horňácko. In our study, we found co-occurrence of 5 variants (4 intron and 1 exon) in the LRRK2 gene in 6 patients and in none of the controls (C1). To obtain greater control group we used data from whole genome sequencing of 100 healthy unrelated individuals from all over the Czech Republic (C2) and data available from the 1000 Genomes Project (C3). Further, the frequency of given haplotype in patients and in these 3 control groups where statistically significant differences (C1, p = 0.0031; C3, p < 0.0001) were found between the patients and C1 and C3 control groups was assessed. The frequency of haplotype in patients and C2 control group, given the lower number of patients, was only at the border of statistical significance (p = 0.11). The following part of our study was focused on whole exome sequencing (WES), when the aim was to choose suitable trios from compiled pedigree of the population of Horňácko, perform WES and evaluate obtained data using two different independent software programs (Ion Reporter and Ingenuity Variant Analysis); then to assess and evaluate the found variants occurring only in patients within individual trios. No founder pathogenic variant inherited across the pedigree was found in this study. On the contrary, we found several variants that were shared among individual trios. We assess the very rare variant in gene for monoamine transporter (SLC18A2) as the most interesting one. This variant was assessed as damaging according to all prediction tools.