Number of the records: 1
Softvérová aplikácia pre MALDI MS intaktných buniek
Title statement Softvérová aplikácia pre MALDI MS intaktných buniek [rukopis] / Simona Martikánová Additional Variant Titles Softwarová aplikace pro MALDI-MS intaktních buněk Personal name Martikánová, Simona, (dissertant) Translated title Software application for MALDI-TS of intact cells Issue data 2021 Phys.des. 68 : il., tab. Note Ved. práce Marek Šebela Oponent Lucie Šimková Another responsib. Šebela, Marek, 1971- (thesis advisor) Šimková, Lucie, (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords MALDI-TOF * spektrum * kontrola * hmotnostná spektrometria * proteín * proteóm * algoritmus * teoretická hmotnosť * sinica * Python * MALDI-TOF * spectrum * control * mass spectrometry * protein * proteome * algorithm * theoretical mass * cyanobacteria * Python Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language slovenština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biochemie Degreee discipline Bioinformatika book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00261397-677642237.pdf 23 3.7 MB 20.05.2021 Posudek Typ posudku 00261397-ved-251817896.pdf Posudek vedoucího 00261397-opon-706646366.pdf Posudek oponenta Ostatní přílohy Size Popis 00261397-other-245288549.zip 24.8 MB 00261397-other-778964107.zip 27.5 MB 00261397-other-567005937.zip 61.5 MB
Hmotnostnou spektrometriou MALDI-TOF intaktných buniek mikroorganizmov sa dajú získať fingerprintové spektrá proteínov obsahujúce charakteristické diagnostické signály. So znalosťou úplnej proteómovej sekvencie je možné priradiť na základe molekulovej hmotnosti jednotlivé signály konkrétnym proteínom. Náplňou práce je pripraviť algoritmus umožňujúci spracovanie proteómových sekvencií vo FASTA formáte do hodnôt molekulových hmotností proteínov a porovnať ich s experimentálnou sadou diagnostických signálov odčítaných zo spektier. Zvolením tolerancie pre zhodu hodnôt teoretických a experimentálnych hmotností, budú tieto signály priradené konkrétnym proteínom. Ďalej bude navrhnutý algorimus, ktorý umožňuje porovnávať signály dvoch spektier medzi sebou a vybrať tie, ktoré sú podobné a rozdielne.With MALDI-TOF mass spectrometry of intact cells of microorganisms, fingerprints spectra of proteins containing characteristic diagnostic signals can be acquired. With knowledge of complete proteomic sequence, individual signals are assigned to particular proteins based on molecular mass. The scope of work is to prepare algorithm enabling processing of proteomic sequences in FASTA format into molecular weight and compare them with an experimental set of diagnostic signals obtained from the spectra. These signals will be assigned to particular protein by selecting a tolerance for matching of theoretical and experimental mass values. Next designed algorithm will compare signals of two different spectra with each other and select similiar and different signals.
Number of the records: 1