Number of the records: 1  

Softvérová aplikácia pre MALDI MS intaktných buniek

  1. Title statementSoftvérová aplikácia pre MALDI MS intaktných buniek [rukopis] / Simona Martikánová
    Additional Variant TitlesSoftwarová aplikace pro MALDI-MS intaktních buněk
    Personal name Martikánová, Simona, (dissertant)
    Translated titleSoftware application for MALDI-TS of intact cells
    Issue data2021
    Phys.des.68 : il., tab.
    NoteVed. práce Marek Šebela
    Oponent Lucie Šimková
    Another responsib. Šebela, Marek, 1971- (thesis advisor)
    Šimková, Lucie, (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor)
    Keywords MALDI-TOF * spektrum * kontrola * hmotnostná spektrometria * proteín * proteóm * algoritmus * teoretická hmotnosť * sinica * Python * MALDI-TOF * spectrum * control * mass spectrometry * protein * proteome * algorithm * theoretical mass * cyanobacteria * Python
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languageslovenština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiochemie
    Degreee disciplineBioinformatika
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    00261397-677642237.pdf233.7 MB20.05.2021
    PosudekTyp posudku
    00261397-ved-251817896.pdfPosudek vedoucího
    00261397-opon-706646366.pdfPosudek oponenta

    Hmotnostnou spektrometriou MALDI-TOF intaktných buniek mikroorganizmov sa dajú získať fingerprintové spektrá proteínov obsahujúce charakteristické diagnostické signály. So znalosťou úplnej proteómovej sekvencie je možné priradiť na základe molekulovej hmotnosti jednotlivé signály konkrétnym proteínom. Náplňou práce je pripraviť algoritmus umožňujúci spracovanie proteómových sekvencií vo FASTA formáte do hodnôt molekulových hmotností proteínov a porovnať ich s experimentálnou sadou diagnostických signálov odčítaných zo spektier. Zvolením tolerancie pre zhodu hodnôt teoretických a experimentálnych hmotností, budú tieto signály priradené konkrétnym proteínom. Ďalej bude navrhnutý algorimus, ktorý umožňuje porovnávať signály dvoch spektier medzi sebou a vybrať tie, ktoré sú podobné a rozdielne.With MALDI-TOF mass spectrometry of intact cells of microorganisms, fingerprints spectra of proteins containing characteristic diagnostic signals can be acquired. With knowledge of complete proteomic sequence, individual signals are assigned to particular proteins based on molecular mass. The scope of work is to prepare algorithm enabling processing of proteomic sequences in FASTA format into molecular weight and compare them with an experimental set of diagnostic signals obtained from the spectra. These signals will be assigned to particular protein by selecting a tolerance for matching of theoretical and experimental mass values. Next designed algorithm will compare signals of two different spectra with each other and select similiar and different signals.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.