Ribozym viru hepatitidy D katalyzuje samoštěpící virovou RNA pomocí acidobazické reakce, ve které je zahrnut nukleotid C75 a nejméně jeden kovový ion. Tato bakalářská práce se zabývá MD simulacemi a pozorováním divokého typu HDV ribozymu, GC mutantu a A+C mutantu s protonovaným či deprotonovaným nukleotidem C75. Sledoval jsem vodíkové vazby a okupanci Na+ iontů v aktivním místě.The hepatitis delta virus (HDV) ribozyme catalyzes viral RNA self-cleavage through general acid-base chemistry in which an active-site cytidine and at least one metal ions are involved. This Bachelor thesis deals with MD simulations and observation of wild type of HDV ribozyme, GC mutant and A+C mutant with protonated or unprotonated C75. I observed H-bond in active site and occupation of Na+ ions in active site.