Number of the records: 1
Bakteriální endosymbionti mer rodu Cacopsylla v kontextu fytoplazmových infekcí
Title statement Bakteriální endosymbionti mer rodu Cacopsylla v kontextu fytoplazmových infekcí [rukopis] / Erika Zrníková Additional Variant Titles Bakteriální endosymbionti mer rodu Cacopsylla v kontextu fytoplazmových infekcí Personal name Zrníková, Erika, (Dissertant) Translated title Bacterial endosymbionts of Cacopsylla psyllids in the context of phytoplasma infections Issue data 2025 Phys.des. 67 s.+ix Note Oponent Milan Navrátil Ved. práce Dana Šafářová Another responsib. Navrátil, Milan (Opponent) Šafářová, Dana (Thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (Degree granting institution) Keywords endosymbionty * 'Candidatus Carsonella rudii' * Cacopsylla pruni * Cacopsylla picta * HTS analýza * Sangerovo sekvenovanie * genetická variabilita * endosymbionts * 'Candidatus Carsonella rudii' * Cacopsylla pruni * Cacopsylla picta * HTS analysis * Sanger sequencing * genetic variability Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language slovenština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Molekulární a buněčná biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie 
book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00295068-460488470.pdf 0 2.9 MB 24.04.2028 Posudek Typ posudku 00295068-ved-173204494.pdf Posudek vedoucího 00295068-opon-775142122.pdf Posudek oponenta
Teoretická časť diplomovej práce sa zaoberá základnou charakteristikou mér rodu Cacopsylla, konkrétne C. picta a C. pruni, ako aj problematikou endosymbiózy, vrátane primárnych a sekundárnych endosymbiontov, ako sú baktérie rodu Wolbachia, Carsonella, Arsenophonus a Rickettsia, a ich vzťahom k fytoplazmovým ochoreniam. Experimentalná časť diplomovej práce sa zameriavala na detekciu endosymbiontov u mér rodu Cacopsylla, pričom sa PCR skríningom potvrdila prítomnosť výlučne 'Candidatus Carsonella ruddii'. Iné bežne uvádzané fakultatívne endosymbionty ako sú zástupcovia rodu Wolbachia, Arsenophonus, Sodalis, Libeberibacter, Sulcia, Nasuia a Profftella sa v analyzovaných vzorkách nepreukázali. Analýzou HTS boli získané dva kompletné a dva parciálne genómy tejto baktérie z C. pruni a dva kompletné genómy z C. picta. Sekvencie získané z 'Ca. C. ruddii' izolované z C. picta vykazovali 99,9% identitu so sekvenciami tohto endosymbiont z rovnakého druhu hostiteľa. Naopak, sekvencie z 'Ca. C. ruddii' izolovanej z C. pruni vykazovali približne 92% identitu so sekvenciami 'Ca. C. ruddii' pochádzajúcimi z C. picta a C. melanoneura. Fylogenetická analýza ukázala, že sekvencie 'Ca. C. ruddii' z C. picta a C. pruni sa vyvetvili do samostatných vetiev, odlišujúcich sa od iných druhov hostiteľov. Genómy 'Ca. C. ruddii' vykazovali štandardnú štruktúru vrátane proteín-kódujúcich génov, rRNA a tRNA. Analýzou genetickej variability boli pomocou Sangerovho sekvenovania získané parciálne sekvencie pre gény Tuf, DnaQ, 16S rRNA a RpoC, pričom bola zistená vysoká homogenita, minimálna vnútrodruhová diverzita viazaná na pôvodného hostiteľa a naopak relatívne vysoká medzidruhová diverzita.The theoretical part of the thesis deals with the basic characteristics of psyllids of the genus Cacopsylla, in particular C. picta and C. pruni, as well as the issue of endosymbiosis, including primary and secondary endosymbionts such as bacteria of the genera Wolbachia, Carsonella, Arsenophonus, and Rickettsia, and their relationship with phytoplasma-related diseases. The experimental part of the thesis focused on the detection of endosymbionts in psyllids of the genus Cacopsylla. PCR screening confirmed the presence of 'Candidatus Carsonella rudii' exclusively. Other commonly reported facultative endosymbionts, such as representatives of the genera Wolbachia, Arsenophonus, Sodalis, Libeberibacter, Sulcia, Nasuia, and Profftella, were not detected in the analyzed samples. High-throughput sequencing (HTS) analysis yielded two complete and two partial genomes of this bacterium from C. pruni, and two complete genomes from C. picta. The sequences of 'Ca. C. ruddii' isolated from C. picta showed 99,9% identity with sequences of this endosymbiont from the same host species. In contrast, the sequences of 'Ca. C. ruddii' isolated from C. pruni showed an approximately 92% identity with sequences of 'Ca. C. ruddii' originating from C. picta and C. melanoneura. Phylogenetic analysis revealed that the sequences of 'Ca. C. ruddii' from C. picta and C. pruni branched into separate clades, distinct from those associated with other host species. The genomes of 'Ca. C. ruddii' had a standard structure, including protein-coding genes, rRNA, and tRNA. Analysis of genetic variability using Sanger sequencing of partial sequences of the Tuf, DnaQ, 16S rRNA, and RpoC genes revealed high homogeneity, minimal intraspecific diversity associated with the original host, and, in contrast, relatively high interspecific diversity.
Number of the records: 1