Number of the records: 1
Charakterizace vybraných aldehyddehydrogenas z čepenky odstálé (Physcomitrella patens) a ječmene setého (Hordeum vulgare L.)
Title statement Charakterizace vybraných aldehyddehydrogenas z čepenky odstálé (Physcomitrella patens) a ječmene setého (Hordeum vulgare L.) [rukopis] / Jakub Bělíček Additional Variant Titles Charakterizace vybraných aldehyddehydrogenas z čepenky odstálé (Physcomitrella patens) a ječmene setého (Hordeum vulgare L.) Personal name Bělíček, Jakub, (dissertant) Translated title Characterization od selected aldehyde dehydrogenases from the moss (Physcomitrella patens) and barley (Hordeum vulgare L.) Issue data 2021 Phys.des. 91 : il., grafy, tab. + CD ROM Note Oponent Petr Tarkowski Ved. práce Radka Končitíková Another responsib. Tarkowski, Petr, 1976- (opponent) Končitíková, Radka (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra biochemie (degree grantor) Keywords ALDH5 * metabolismus GABA * SSAL * ječmen * čepenka odstálá * SSADH * ALDH5 * GABA-shunt * SSAL * succinic semialdehyde dehydrogenase * barley * Physcomitrella patens Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biochemie Degreee discipline Biochemie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00263661-725127978.pdf 0 2.8 MB 31.12.2999 Posudek Typ posudku 00263661-ved-231289096.pdf Posudek vedoucího 00263661-opon-414922782.pdf Posudek oponenta
Významnou skupinou aldehyddehydrogenas jsou tzv. sukcinyl-semialdehyddehydrogenasy, jež se zásadním způsobem podílejí na katabolismu -aminomáselné kyseliny. V rámci této diplomové práce byly charakterizovány dvě isoformy sukcinyl-semialdehyddehydrogenas z mechu čepenky odstálé (Physcomitrella patens) a isoforma přítomná v ječmeni setém (Hordeum vulgare L.). Všechny studované enzymy vykazovaly úzkou specifitu vůči substrátu sukcinyl-semialdehydu a koenzymu NAD+. Pro substrát sukcinyl-semialdehyd a koenzymy NAD+ a NADP+ byly vyřešeny kinetické parametry Vlim, KM a kcat. U všech tří isoforem byla pozorována inhibice nadbytkem substrátu sukcinyl-semialdehydu při použití koenzymu NAD+. Kromě kinetických parametrů byly enzymy studovány z hlediska vlivu pH, soli, glycerolu a koenzymů NAD(P)+ na stabilitu a sekundární strukturu proteinů. Přítomnost ligandu NAD+ u enzymů PpALDH5A a HvALDH5 měla na proteiny stabilizační účinek. U isoformy PpALDH5B překvapivě došlo k destabilizaci po vazbě ligandu NAD(P)+. Přídavek soli o koncentraci 300 mmoll-1 a výše měl u enzymů výrazně destabilizační vliv. Z hlediska kvartérní struktury vytvářejí všechny tři enzymy tetramery, jejichž aktivní místo i koenzym-vazebná doména jsou tvořeny vysoce konzervovanými residui napříč všech NAD+-dependentních sukcinyl-semialdehyddehydrogenas.Succinic semialdehyde dehydrogenases (SSADH) create an important group of aldehyde dehydrogenase superfamily. These enzymes are involved in GABA-metabolism as a part of the GABA-shunt pathway. This diploma thesis is focused on characterization of two Physcomitrella and one barley SSADH isoforms. All three enzymes have shown a narrow substrate specifity to succinic semialdehyde (SSAL) and NAD+-coenzyme. Kinetic parametres (Vlim, KM and kcat) were determined for the substrate SSAL and coenzymes NAD+ and NADP+. Substrate inhibition for SSAL and coenzyme NAD+, characteristic of ALDH5, has been observed for all three isoforms. Beside to the kinetic assay, enzymes have been studied for the effect of pH, salt, glycerol and NAD(P)+ on the stability and secondary structure. The addition of NAD+ ligand have a stabilizing effect on the proteins PpALDH5A a HvALDH5. Surprisingly, the PpALDH5B isoform has been destabilized after NAD+ ligand binding. Salt with a concentration od 300 mmoll-1 or higher has a significant destabilizating effect on the enzymes. Based on the gel filtration chromatography, all free enzymes form tetrameric quartery structure. The active side and coenzyme-binding domain of ALDH5 enzymes are formed by highly conserved residues across all NAD+-dependent succinic-semialdehyde dehydrogenases.
Number of the records: 1