Number of the records: 1
Výskyt oxacilináz u vybraných Gram-negatívnych baktérií
Title statement Výskyt oxacilináz u vybraných Gram-negatívnych baktérií [rukopis] / Andrea Chalachanová Additional Variant Titles Výskyt oxacilináz u vybraných Gram-negatívnych baktérií Personal name Chalachanová, Andrea (dissertant) Translated title Prevalence of oxacillinases in selected Gram-negative bacteria Issue data 2019 Phys.des. ix, 60 s. (132 025 znakov) + 1 CD ROM Note Oponent Ondřej Holý Ved. práce Patrik Mlynárčik Another responsib. Holý, Ondřej (opponent) Mlynárčik, Patrik, (thesis advisor) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords beta-laktámové antibiotiká * Gram-negatívne baktérie * PCR * oxacilinázy * primery * antimikrobiálna rezistencia * beta-lactams antibiotics * Gram-negative bacteria * PCR * oxacilinases * primers * antimicrobial resistance Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language slovenština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00225317-350605896.pdf 22 2.1 MB 25.04.2019 Posudek Typ posudku 00225317-ved-846327904.pdf Posudek vedoucího 00225317-opon-836884586.pdf Posudek oponenta
Predkladaná diplomová práca sa zaoberá štúdiom oxacilináz (OXA) u vybraných druhov Gram-negatívnych baktérií, a to Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae a Acinetobacter baumannii. Teoretická časť práce je venovaná základnej charakteristike patogénov s dôrazom na čeľaď Enterobacteriaceae, definícii a klasifikácii beta-laktámových antibiotík, typom bakteriálnych obranných mechanizmov a charakteristike jednotlivých tried beta-laktamáz, predovšetkým beta-laktamáz triedy D. K skríningu oxacilináz u vybraných druhov baktérií bola použitá PCR amplifikácia s využitím špecifických párov oligonukleotidov navrhnutých pomocou bioinformatického softvéru Geneious. U klinických izolátov K. pneumoniae a E. cloacae bol potvrdený výskyt blaOXA-1-like génov. Klinický izolát A. baumannii bol pozitívny na enzýmy OXA-23-like, OXA-51-like, OXA-58-like, OXA-211-like a OXA-228-like. Výsledky štúdie potvrdili špecifickosť navrhnutých párov oligonukleotidov. Zistené bolo, že navrhnuté primery disponujú schopnosťou špecificky detegovať 90,3 % zo všetkých oxacilináz popísaných v BLDB databáze. In silico analýzou sekvencií reprezentatívnych oxacilináz bol potvrdený výskyt zachovaných aminokyselinových motívov.The submitted diploma thesis deals with the study of oxacillinases (OXA) in selected species of Gram-negative bacteria, namely Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae and Acinetobacter baumannii. The theoretical part of thesis is devoted to basic characteristics of pathogens with an emphasis on Enterobacteriaceae family, definition and classification of beta-lactam antibiotics, types of bacterial defensive mechanisms and characteristics of individual classes of beta-lactamases, especially class D beta-lactamases. Screening of oxacillinases of selected bacterial species was performed by PCR amplification using specific pairs of oligonucleotides designed by bioinformatics software Geneious. Genes blaOXA-1-like have been found in clinical isolates of K. pneumoniae and E. cloacae. Clinical isolate of A. baumannii has been positive for OXA-23-like, OXA-51-like, OXA-58-like, OXA-211-like and OXA-228-like enzymes. The study results confirmed the specificity of the designed oligonucleotide pairs. It was found that the designed primers possess the ability to specifically detect 90.3 % of all oxacillinases described in the BLDB database. The presence of conserved amino acid motifs was confirmed by in silico analysis of sequences of representative members of oxacillinases.
Number of the records: 1