Number of the records: 1
Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u plameňáka karibského (Phoenicopterus ruber)
Title statement Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u plameňáka karibského (Phoenicopterus ruber) [rukopis] / Alžběta Zlochová Additional Variant Titles Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u plameňáka karibského (Phoenicopterus ruber) Personal name Zlochová, Alžběta, (dissertant) Translated title Cross-species amplification of microsatellites from Sphenisciformes and conserved avian microsatellites in Caribbean Flamingo (Phoenicopterus ruber) Issue data 2017 Phys.des. 59 : il., grafy, tab. + 1 CD ROM Note Ved. práce Petr Nádvorník Oponent Miloslav Kitner Another responsib. Nádvorník, Petr (thesis advisor) Kitner, Miloslav (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords plameňák karibský (Phoenicopterus ruber) * mikrosatelity * polymorfní mikrosatelity * EST mikrosatelity * cross-species PCR amplifikace * Caribbean Flamingo (Phoenicopterus ruber) * microsatellites * polymorphic microsatellites * EST microsatellites * cross-species PCR amplification Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses UDC (043)378.22 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Bc. Degree program Bakalářský Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 00203881-522815407.pdf 87 1.1 MB 31.07.2017 Posudek Typ posudku 00203881-ved-343032007.pdf Posudek vedoucího 00203881-opon-468841914.pdf Posudek oponenta Call number Barcode Location Sublocation Info BP-KBB/314 (PřF-KBO) 3134520701 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
V této bakalářské práci jsem hledala pomocí cross-species PCR amplifikace polymorfní mikrosatelity, které se vyskytují u plameňáka karibského (Phoenicopterus ruber). Byly amplifikovány mikrosatelity z řádu tučňáci a také univerzální ptačí mikrosatelity EST mikrosatelity a konzervované ptačí mikrosatelity. V teoretické části jsem se zabývala obecnou charakteristikou plameňáků, řešila jsem problematiku zařazení plameňáků do systému ptáků a charakterizovala jsem plameňáka karibského. Dále jsem se zaměřila na obecnou charakteristiku mikrosatelitů a popsala jsem mikrosatelity odvozené z řádu tučňáci a univerzální ptačí mikrosatelity. V experimentální části jsem řešila cross-species PCR amplifikaci 171 párů primerů pro amplifikaci polymorfních mikrosatelitů u 6 nepříbuzných jedinců plameňáka karibského. Z nich bylo 113 párů primerů navrženo pro mikrosatelity odvozené od 9 druhů z řádu tučňáci a 58 párů primerů bylo pro univerzální ptačí mikrosatelity. Nalezla jsem 23 párů primerů, které amplifikovaly polymorfní produkt, z nichž bylo 16 párů primerů pro mikrosatelity popsané u 6 druhů z řádu tučňáci, 4 páry primerů byly pro konzervované ptačí mikrosatelity a 3 páry primerů byly navrženy pro EST mikrosatelity. U polymorfních mikrosatelitů jsem detekovala od 2 do 7 alel.The aim of my bachelor thesis was to find polymorphic microsatellites using the cross-species PCR amplification method. In Caribbean Flamingo (Phoenicopterus ruber) tested polymorfic microsatellites from the order Sphenisciformes, conserved avian microsatellites and EST microsatellites. In the theoretical part I focused on general characterisation of flamingos, their phylogenetical position in the avian system and detailed characterisation of the Caribbean flamingo. I also described general characteristics of microsatellites and those which are derived from the order Sphenisciformes and universal avian microsatellites. Experimental part consisted the cross-species PCR amplification of 171 primer pairs which were used to amplify polymorphic microsatellites in 6 unrelated Caribbean flamingo individuals. Out of these 171, 113 primer pairs were designed for the microsatellites derived from 9 species of the order Sphenisciformes and the other 58 primer pairs were designed for the universal avian microsatellites. I found 23 primer pairs in total which amplified a polymorphic product, out of which 16 primer pairs were for the microsatellites of the order Sphenisciformes, 4 primer pairs were for the conserved avian microsatellites and 3 primer pairs were for the EST microsatellites. I detected from 2 to 7 alleles per locus.
Number of the records: 1