Vratislavská, Michaela
Molekulární evoluce všivce statného a všivce Hacquetova [rukopis] / Michaela Vratislavská. -- 2016. -- 48 : mapy, grafy, tab. -- Oponent Martin Duchoslav. -- Ved. práce Jakub Těšitel. -- Abstract: Tato diplomová práce se zabývá molekulární variabilitou všivce statného (Pedicularis exaltata) a jejím cílem bylo zrekonstruovat jeho evoluční historii. Zároveň byly pro porovnání zkoumány jeho příbuzné druhy, a to všivec Hacquetův (P. hacquetii), se kterým bývá často zaměňován, a všivec chocholatý (P. comosa). Bylo zkoumáno 141 vzorků z celkem 17 populací z České republiky, Slovenské republiky, Rumunska, Ukrajiny, Rakouska a Slovinska. Data byla analyzována pomocí metody AFLP a sekvenování DNA úseků rpl32, trnT-L a ITS. Ze všech analýz je zřejmé, že P. comosa je samostatný druh. U komplexu P. exaltata a P. hacquetii byla odhalena nízká mezidruhová a naopak vysoká vnitropopulační a vnitrodruhová variabilita pomocí analýzy molekulární variance. Podrobnější analýzy AFLP dat, analýza hlavních koordinát PCoA a metody STRUCTURE, ukázaly náznak fylogeografické struktury, která je však odlišná od tradičního pojetí hranice mezi druhy P. exaltata a P. hacquetii. Přímé sekvenování DNA neodhalilo existenci haplotypů charakteristických pro jeden nebo druhý druh. Náznak mezidruhových rozdílů lze pozorovat v PCoA chloroplastových mikrosatelitů. Tyto výsledky celkem jasně ukazují, že oddělování P. exaltata a P. hacquetii jako samostatných druhů není opodstatněné, přičemž správné jméno, které by se pro tento jediný druh mělo použít, je Pedicularis hacquetii.. -- Abstract: This thesis investigated molecular variability of Pedicularis exaltata to reconstruct its evolutionary history. Its closely related congeners Pedicularis hacquetii and Pedicularis comosa were also included in the analysis to test the species delimitations. I investigated 141 samples from 17 location in area at the Czech republic, Slovakia, Romania, Ukraine, Austria and Slovenia. The data were analysed by AFLP and DNA sequencing of rpl32, trnT-L and ITS loci. P. comosa was demonstrated as a clearly separated species according by all molecular markers. Low between-species variability coupled with high interpopulation and intrapopulation variability was revealed in the P. exaltata-P.hacquetii complex by an analysis of molecular variance (AMOVA) of the AFLP data. Principal coordinate analysis and a STRUCTURE analysis showed a weak phylogeographic structure which was however unrelated to the taxonomic differentiation between P. exaltata and P. hacquetii. Only a trace of such differentiation can be observed in chloroplast microsatellite data. Species delimitation between P. exaltata and P. hacquetii is therefore not substantiated and their populations should be considered members of a single species Pedicularis hacquetii.
Duchoslav, Martin, 1971-. Těšitel, Jakub. Univerzita Palackého. Katedra ekologie a životního prostředí
Alpy. AFLP. DNA sekvenace. izolace DNA. Karpaty. Alps. AFLP. Carpathians. DNA sequence. DNA isolation. diplomové práce
(043)378.2