Sekce Codonoprasum je v rámci rodu Allium jednou z nejpočetnějších sekcí, která je rozšířena po celé evropsko-mediteránní oblasti. Jedná se o jednu z taxonomicky nejkomplikovanějších sekcí v rámci rodu, a to zejména díky častému výskytu polyploidie, hybridizace a vysoké morfologické variabilitě jednotlivých taxonů. Známé nejsou ani základní fylogenetické vztahy uvnitř této sekce. Ke zjištění příbuzenských vztahů a vybraných taxonů ze sekce Codonoprasum z různých geografických oblastí byla použita metoda AFLP. Dále byla studována na populačních vzorcích těchto taxonů morfologická variabilita a anatomická struktura listu a znaky na povrchu epidermis. Výsledky ukázaly na existenci dvou vzájemně geneticky odlišných skupin druhů (A. dentiferum + A. pallens vs. zbývající druhy) a na malou genetickou diferenciaci taxonů v okruhu A. paniculatum. Allium oleraceum je geneticky heterogenní, patrně polyfyletický taxon.The section Codonoprasum Rchb. is, within the genus Allium, a very large section widespread in the Euro-Mediterranean area. It is traditionally regarded as one of the taxonomically most complicated sections within the genus due to the widespread occurence of polyploidy, the high incidence of hybridisation, and the greatly morphological variability of the species. The basal phylogeny of this group was also not resolved. To assess relationships and genotypic variability among selected species of the genus Allium section Codonoprasum from different populations, the AFLP techique was applied. Taxonomy and relationships of this complicated section are also studied on morphological analysis. Additionally, one of the aims of this master thesis was to analyse leaf blade anatomical characters and epidermal characters of the selected species. AFLP analysis showed that studied taxa composee two genetically different groups (A. dentiferum + A. pallens vs. remaining taxa) and low genetic differentiation of taxa within A. paniculatum complex. Allium oleraceum is probably heterogeneous, polyphyletic taxon.