Předkládaná diplomová práce má za cíl poskytnout informace o chování nanočástic pomocí kapilární elektroforézy, to vše se zaměřením pro biologické účely. Teoretická část se zabývá studiem nanočástic a kapilární elektroforézy. První kapitoly se věnují obecné charakteristice nanočástic a přináší soupis jejich různých typů. Použití nanočástic je zaměřeno na možnosti jejich uplatnění v lékařských vědách, do nichž stále více pronikají. Pomáhají zdokonalovat lékařské postupy, jak diagnostické, tak léčebné, především s ohledem na nádorová onemocnění. Samostatná kapitola se týká elektromigračních technik, zejména kapilární elektroforézy. Popisuje její základní mechanismy a využití pro analýzu nanočástic a medicínské vzorky. Experimentální část shrnuje poznatky o chování dvou typů nanočástic - Ag a smAA-COOH nanočástic v různých typech elektrolytů pomocí výše zmíněné metody. Snaží se popsat jejich chování v prostředích blízkých buňkám. Hledá vhodné podmínky, za kterých by nedocházelo k ohrožení v biologickém systému, například agregací nanočástic.This diploma thesis provides information about the behavior of nanoparticles using capillary electrophoresis, all focusing for biological purposes. The theoretical part deals with the study of nanoparticles and capillary electrophoresis. The first chapter is devoted to the general characteristics of the nanoparticles and the following is a description of their different types. The next chapters concern the use of the nanoparticles, first of all on the possibilities of their application in medical sciences, where they found the right place. They are helped to improve medical procedures, both diagnostic and therapeutic, especially in a cancer treatment. Separate chapters concern with electromigration techniques, particularly with capillary electrophoresis. It describes the basic mechanisms and its use in the analysis of nanoparticles and biological samples. The experimental part summarizes the finding of behavior the two types of nanoparticles - Ag and SmaA-COOH in various types of electrolytes using the above methods. It tries to describe the behavior of nanoparticles in biological media. It tries to find suitable conditions under which there would be no danger in a biological system, such as the aggregation of nanoparticles.