Náplní této práce bylo popsat flexibilitu aktivního místa lidského cytochromu P450 CYP2E1. Flexibilita aktivního místa byla zkoumána pomocí analýzy dat získaných molekulárně dynamickými (MD) simulacemi provedenými za podmínek normálního (p = 1 atm) a vysokého tlaku (p = 3000 atm). První část práce shrnuje dosavadní znalosti o studovaném cytochromu P450 CYP2E1 a v závěru jej srovnává s příbuzným systémem CYP3A4 ze stejné nadrodiny. Experimentální část je věnována analýze dat z MD simulací, kde byla zkoumána stabilita systému (RMSD), vliv podmínek MD simulace na velikost molekuly CYP2E1 (Rg), flexibilita (Bf) a solvatace aktivního místa (RDF). Pro popis solvatace aktivního místa bylo navíc provedeno vizuální zhodnocení počtu molekul vody v okolí CO sondy aktivního místa. Pro doplnění údajů o flexibilitě aktivního místa CYP2E1 bylo provedeno měření objemu kavity aktivního místa systému CYP2E1 i CYP3A4. Z výsledků analýzy dat MD simulací lze říci, že flexibilita aktivního místa lidského cytochromu P450 CYP2E1 je sice poměrné nízká, ale možnost interakce s přídavnou kavitou jej činí mnohem flexibilnější a umožňuje dostatečné konformační přizpůsobení, díky němuž je pak CYP2E1 schopen metabolizovat i substráty velikosti mastných kyselin. Solvatace aktivního místa je nízká a naznačuje hydrofobní charakter kavity aktivního místa. Po srovnání výsledků pro CYP2E1 s výsledky analýzy pro CYP3A4 je patrné, že CYP3A4 je méně stabilním, avšak flexibilnějším systémem než CYP2E1 a jeho aktivní místo je mnohem objemnější, což odpovídá jeho schopnosti metabolizovat velké substráty jako je např. erythromycin.The goal of this work was study of active site flexibility of cytochrome P450 CYP2E1. Flexibility of active site was studied by analysis of data obtain from molecular dynamics (MD) simulations at normal (p = 1 atm) and high pressure (p = 3000 atm). First part of this work summarizes current knowledge about studied cytochrome P450 CYP2E1, which is later in the conclusion compared with relative system CYP3A4 from same superfamily. Experimental part is dedicated to analysis of data from MD simulations, where were studied stability of system (RMSD), influence of conditions at MD simulations for size of molecule of CYP2E1 (Rg), flexibility (Bf) and solvation of active site (RDF). Visual measurement of number of water molecules surrounding CO probe of active site was performed in addition for characterization of active site solvation. For completion of details of active site flexibility of CYP2E1 measurement of volume of active site cavity for CY2E1 and CYP3A4 was performed. From results of MD simulation analysis we can say, that active site flexibility is relatively narrow, but ability of interaction of active site cavity with adjacent cavity causes it more flexible and enable sufficient conformational adaptation, which means that CYP2E1 may metabolize even substrates, which are large as fatty acids. Active site solvation is relatively narrow and it means that active site cavity has hydrophobic character. Comparing results for CYP2E1 with results of analysis for CYP3A4 it is evident, that CYP3A4 is less stable, although more flexible system than CYP2E1 and its active site is larger, which corresponds with its ability of metabolizing large substrates like erythromycin.