Protoplastové kultury se vyznačují tím, že mají schopnost obnovit pluripotenci během diferenciace. Během tohoto děje se mění organizace jaderného genomu na úrovni genetické i epigenetické. Regenerační potenciál protoplastů závisí především na druhu a genotypu rostliny a na použitém explantátu a jeho stáří. Pomocí specifických protilátek byly pozorovány epigenetické změny (metylace DNA, fosforylace, acetylace, dimetylace histonů) jaderných genomů protoplastů okurky seté (Cucumis sativus L.) kultivovaných v 0 hodin, 24 hodin, 48 hodin a 72 hodin po izolaci a jaderného genomu izolovaného z listu téhož druhu. Naměřené hodnoty byly mezi sebou porovnávány.Protoplast culture is characterized by having the ability to restore pluripotency during differentiation. During this process, protoplasts change the organization of the nuclear genome at the genetic and epigenetic level. Regeneration potential of protoplasts depends on the type and plant genotype and the use of explant and its age. Using specific antibodies were observed epigenetic changes (DNA methylation, histone phosphorylation, acetylation and dimethylation) of genomes of cucumber (Cucumis sativus L.) protoplasts cultivated at 0 hours, 24 hours, 48 hours and 72 hours after isolation and nuclear genome isolated from leaf of the same species. The measured values were compared among themselves.