Diplomová práce je zaměřena na rozbor nejdůležitějších institutů a postupů vztahujících se k daňovému řízení, nejvíce pak k dokazování podle platných právních předpisů a soudních rozhodnutí. Hlavní část diplomové práce pojednává o postupu při dokazování v daňovém řízení, jednotlivých důkazních prostředcích a důkazním břemenu. Závěrečná část je věnována souvislostem a odlišnostem daňového a trestního řízení.The Thesis is focused on analysis of the most important institutes (instruments) and procedures involved in taxation procedure and then mostly in evidence according to the current legal regulations and judicial verdicts. The main part of the Thesis discusses routing of evidence during the taxation procedure, particular proper evidences and burden of proof. Final part is dedicated to connections and differences between taxation procedure and criminal procedure.