Náplní práce je souhrnná charakterizace principiálních chromatografických technik, využívaných pro separaci a purifikaci proteinů. Důraz je kladen na vysvětlení pojmů, principů a procesů v chromatografické separaci proteinů. Pozornost je také soustředěna na jednotlivé konkrétní techniky, zejména gelovou permeační chromatografii. Jsou diskutovány faktory, které mají na separaci významný vliv a uvedeny přednosti a omezení každé chromatografické techniky. Také jsou popsány zásady efektivní kombinace technik v rámci třífázové purifikační strategie. Praktickým přínosem práce je studium selektivity komerčních gelových filtračních médií Perlozy MT 300 a 500. Část dosažených výsledků je porovnána se souvisejícími výsledky získanými od firmy Iontosorb, která Perlozu MT vyvinula. Je zhodnocena použitelnost obou médií pro separace proteinů.This thesis is focused on a summarizing description of fundamental chromatography techniques that are used for protein separation and purification. Emphasis is made here on the explanation of terms, principles and processes in protein chromatography. The accent is also put on particular techniques, especially gel permeation chromatography. Factors of significant influence on the separation have been discussed as well as advantages and limits of each chromatographic technique. Principles of effective combination of techniques within the framework of the three phase purification strategy have been decribed as well. In the experimental part, the selectivity of commercial gel filtration media Perloza MT 300 a 500 has been investigated. A part of the results achieved was compared with related results obtained from the private firm Iontosorb that has developed the media Perloza MT. Suitability of both media for protein separation was evaluated.