Number of the records: 1  

Dynamika vybraných RNA motivů

  1. Title statementDynamika vybraných RNA motivů [rukopis] / Pavel Polakovič
    Additional Variant TitlesDynamika vybraných RNA motivů
    Personal name Polakovič, Pavel (dissertant)
    Translated titleDynamics of Selected RNA Motives
    Issue data2009
    Phys.des.75 s. : il., grafy, tab. + CD ROM
    NoteVed. práce Michal Otyepka
    Another responsib. Otyepka, Michal, 1975- (thesis advisor)
    Banáš, Pavel (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (degree grantor)
    Keywords Ribozym viru hepatitidy D * samoštěpící virová RNA * acidobazická reakce * mechanismus obecné zásadý * mechanismus obecné kyseliny * The hepatitis delta virus (HDV) ribozyme * iral RNA self-cleavage * acid-base reaction * general base mechanism * general acid mechanism
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programChemie
    Degreee disciplineManagement v chemii
    book

    book

    Kvalifikační práceDownloadedSizedatum zpřístupnění
    74041-120511781.pdf584.6 MB11.05.2009

    Ribozym viru hepatitidy D katalyzuje samoštěpící virovou RNA pomocí acidobazické reakce, ve které je zahrnut nukleotid C75 a nejméně jeden kovový ion. Tato bakalářská práce se zabývá MD simulacemi a pozorováním divokého typu HDV ribozymu, GC mutantu a A+C mutantu s protonovaným či deprotonovaným nukleotidem C75. Sledoval jsem vodíkové vazby a okupanci Na+ iontů v aktivním místě.The hepatitis delta virus (HDV) ribozyme catalyzes viral RNA self-cleavage through general acid-base chemistry in which an active-site cytidine and at least one metal ions are involved. This Bachelor thesis deals with MD simulations and observation of wild type of HDV ribozyme, GC mutant and A+C mutant with protonated or unprotonated C75. I observed H-bond in active site and occupation of Na+ ions in active site.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.