Banánovník je významná hospodářská plodina, na níž jsou nutričně závislé miliony lidí v rozvojových zemích. V poslední době je ale banánovník ohrožován stále se rozšiřujícím okruhem patogenních hub, bakterií, virů a hmyzích škůdců, kteří rostlině způsobují četné choroby a snižují tak produkci banánů. Aby bylo možné šlechtit odrůdy banánovníku odolné proti patogenům a navíc s vysokými výnosy, je třeba více porozumět i struktuře jaderného genomu této rostliny. Jaderný genom banánovníku je relativně malý a jeho chromozomy jsou morfologicky velmi podobné. Pro odlišení jednotlivých chromozomů je zapotřebí vhodných molekulárních markerů. Mezi tyto vhodné markery patří především repetitivní sekvence DNA, které představují významnou část jaderného genomu banánovníku. V předkládané diplomové práci byla studována lokalizace specifických tandemově uspořádaných sekvencí DNA v jaderném genomu vybraných zástupců rodu Musa metodou fluorescenční in situ hybridizace. Cytogeneticky byly poprvé zamapovány dvě specifické tandemové repetitivní sekvence CL18 a CL33 charakterizované na základě analýzy dat ze 454 sekvenování. Dále byla pozorována vzájemná kolokalizace těchto tandemových repetitivních sekvencí DNA s dříve charakterizovaným jednokopiovým BAC klonem 2G17 a 5S rRNA geny. Na základě cytogenetické lokalizace specifických sekvencí DNA byly identifikovány některé mitotické chromozomy v genomu vybraných druhů banánovníku a jejich hybridů. Dále byla provedena analýza diverzity tandemové repetitivní sekvence CL18 na molekulární úrovni. Byla zjištěna vysoká míra podobnosti mezi druhy Musa acuminata a Musa balbisiana, což naznačuje jejich společný evoluční původ.Banana (Musa spp.) is an important agricultural plant and staple food for millions of people in developing countries. Recently, the banana production is threatened by numerous fungal, bacterial, viral diseases and pests. To assist breeding of resistant banana cultivars giving higher yields, better knowledge on the nuclear genome structure is eligible. The banana nuclear genome is relatively small and consists of small and morphologically very similar chromosomes. To enable identification of individual chromosomes a set of suitable molecular markers is necessary. It has been shown previously that repetitive sequences can be used for this purpose with success. These sequences represent a substantial portion of banana nuclear genome. In the presented work, the localization of specific tandem repeats was studied in selected members of the Musaceae family using fluorescence in situ hybridization. We first described the localization of CL18 and CL33 tandem repeats which were identified by 454 sequencing. Simultaneously localization as well as co-localization of CL18, CL33, 5S rRNA genes and single-copy BAC clone 2G17 in various combinations was studied. Our results helped to identify a number of chromosomes in the genomes of selected members of the Musaceae family including their hybrids. Furthermore, the CL18 tandem repeat was characterized on the molecular level in selected members of the Musaceae family. The results of this diversity study confirmed high level of similarity between Musa acuminata and Musa balbisiana, suggesting their close evolutionary relationship.