Number of the records: 1  

Polymorfní DNA mikrosatelity u čápa bílého (Ciconia ciconia)

  1. Title statementPolymorfní DNA mikrosatelity u čápa bílého (Ciconia ciconia) [rukopis] / Eva Burianová
    Additional Variant TitlesPolymorfní DNA mikrosatelity u čápa bílého (Ciconia ciconia)
    Personal name Obručová, Eva (dissertant)
    Translated titlePolymorphic DNA microsatellites in White Stork (Ciconia ciconia)
    Issue data2009
    Phys.des.53 s. (12 592 znaků) + 1 CD ROM
    NoteVed. práce Petr Nádvorník
    Another responsib. Nádvorník, Petr (thesis advisor)
    Kučerová, Lenka (opponent)
    Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor)
    Keywords čáp bílý * mikrosatelity * cross-species amplifikace * white stork * microsatellites * cross-species amplification
    Form, Genre bakalářské práce bachelor's theses
    UDC (043)378.22
    CountryČesko
    Languagečeština
    Document kindPUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitleBc.
    Degree programBakalářský
    Degree programBiologie
    Degreee disciplineMolekulární a buněčná biologie
    book

    book

    Call numberBarcodeLocationSublocationInfo
    BP-KBB/075 (PřF-KBO)3134510607PřF-HolicePřF, Knihovna Holice - skladIn-Library Use Only

    Mikrosatelity jsou krátké úseky DNA, které se skládají z tandemově se opakujících jednotek. V dnešní době patří mezi nejpoužívanější genetické markery. Díky svým jedinečným vlastnostem jsou vhodnými nástroji pro populačně-genetické analýzy, studium příbuzenských vztahů a určování paternity. Tato práce se zabývá hledáním nových polymorfních mikrosatelitových markerů pro čápa bílého (Ciconia ciconia). Pro hledání byla zvolena metoda PCR amplifikace s použitím cross-species primerů taxonomicky příbuzných druhů. Získané amplikony se následně separovaly pomocí elektroforézy v 6% polyakrylamidovém gelu. Celkem bylo touto metodou otestováno 167 párů primerů, které již dříve poskytovaly polymorfní produkt u ptáků z řádu brodivých (Ciconiiformes), plameňáků (Phoenicopteriformes), potápek (Podicipediformes), veslonohých (Pelecaniformes), vrubozobých (Anseriformes), tučňáků (Spehnisciformes), a jeden pár primerů od savců z řádu sudokopytníků (Artiodactyla). Testováním bylo nalezeno 20 polymorfních mikrosatelitových lokusů, u nichž byla zoptimalizována teplota annealingu PCR reakce. U dvou párů mikrosatelitových lokusů bylo zjištěno, že se jedná o ortologní mikrosatelity (páry lokusů Eru07, Eru09 a WS? 17, WS? 18). Nakonec tedy bylo u čápa bílého získáno 18 nezávislých polymorfních mikrosatelitových lokusů.Microsatellites are short DNA segments composed of tandem repeat units. At present they constitute the most widely employed type of genetical markers. Owing to their unique features they are suitable instruments for population-genetic analyses and studies of kinship and parentage. The aim of this bachelor thesis was to obtain new polymorphic microsatellite markers for white stork (Ciconia ciconia). A PCR amplification method using cross-species primers of taxonomically related species was utilized for this purpose. The obtained PCR products were subsequently separated by electrophoresis in 6% polyacrylamide gel. Overall 167 pairs of bird primers, which had previously been providing PCR polymorphic product for orders Ciconiiformes, Phoenicopteriformes, Podicipediformes, Pelecaniformes, Anseriformes, Spehnisciformes and a pair of mammal primers for order Artiodactyla were tested by this method. Twenty polymorphic microsatellite loci have been discovered by this method. The PCR annealing temperature of each locus has been optimized. However, two pairs of the microsatellite loci have manifested themselves in the tests as orthologues microsatellites (loci Eru07, Eru09 and WS? 17, WS? 18). Therefore 18 independent polymorphic microsatellite markers for white stork have been obtained in the end.

Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.