Number of the records: 1
Variabilita nukleotidových sekvencí viru žluté zakrslosti cibule (OYDV) a experimentální okruh hostitelů
Title statement Variabilita nukleotidových sekvencí viru žluté zakrslosti cibule (OYDV) a experimentální okruh hostitelů [rukopis] / Zuzana Gorgolová Additional Variant Titles Variabilita nukleotidových sekvencí viru žluté zakrslosti cibule (OYDV) a experimentální okruh hostitelů Personal name Gorgolová, Zuzana (dissertant) Translated title Variability of nucleotide sequences of Onion yellows dwarf virus (OYDV) isolates and their experimental host range Issue data 2009 Phys.des. 58 s (71 040 znaků) + 1 CD Note Ved. práce Dana Šafářová Another responsib. Šafářová, Dana (thesis advisor) Navrátil, Milan (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords OYDV * česnek * cibule * Potyvirus * OYDV * garlic * onion * Potyvirus Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Kvalifikační práce Downloaded Size datum zpřístupnění 60161-298012097.pdf 0 3.3 MB 31.12.2999 Call number Barcode Location Sublocation Info DP-KBB/023 (PřF-KBO) 3134510518 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Virus žluté zakrslosti cibule (OYDV) je zástupcem rodu Potyvirus, čeleď Potyviridae. Jeho genetická informace je nesená jednovláknovou RNA s mRNA funkcí zakončenou polyadenylovaným koncem. Virový genom kóduje jeden polyprotein, který je virovými proteasami štěpen na 10 funkčních proteinů. OYDV je celosvětově rozšířeným patogenem rostlin rodu Allium. Mezi hostiteli je přenášen mšicemi neperzistentním způsobem. Typickým příznakem infekce rostliny virem je žlutá proužkovitost na listech. Infekce rostliny virem výrazně snižuje výnos a kvalitu plodin. Celkem bylo v této práci charakterizováno 12 izolátů OYDV z různých hostitelů a různého geografického původu, a to 3 izoláty získané z české cibule, 6 izolátů původem z českého česneku, 2 izoláty z česneků dovezených z Asie a 1 izolát původem z asijského Allium ampeloprasum. Byla stanovena hostitelská specifita jednotlivých izolátů, kdy bylo prokázáno, že izoláty získané z cibule jsou přenosné pouze na cibuli, kdežto izoláty získané z česneku (českého i asijského) jsou přenosné jak na česnek, tak s nižší úspěšností i na cibuli. Fylogenetická analýza založená na zjištění variability CP a NIb genů a NIa-Pro/NIb genů prokázala blízkou příbuznost ?cibulových? izolátů a jejich odlišnost od izolátů ?česnekových?. Stejně tak byla zjištěna odlišnost českých ?česnekových? izolátů od materiálů asijských. Asijské izoláty zkoumané v této práci byly podobné ostatním izolátům asijského původu. Zjištěné rozdíly jsou v souladu s původním hostitelským spektrem, jakož i s geografickým původem materiálů.Onion yellow dwarf virus (OYDV) is member of genus Potyvirus, family Potyviridae. The viral genetic information is carried by positive sense single-stranded RNA with polyA tail. The genom encodes one large polyprotein cut by viral proteases into 10 mature proteins. OYDV is worldwide pathogen of Allium sp. The virus is transmited by aphids in non-persistent manner. Typical symptoms of viral infection is yellow striping on leaves. The infection cause significant yield loss and production of low-quality bulbs. Set of 12 selected OYDV isolates was characterized in this work. It involves 3 Czech isolates from onion, 6 Czech isolates from garlic, 2 Asian isolates from garlic and 1 Asian isolate from Allium ampeloprasum. The host specifity was also studied. Viral isolates coming from onion are transmittable only to onions. Viral isolates from garlic are transmittable to garlic, but also with low probability to onions. Phylogenetic analysis based on variability of CP and NIb genes and NIa-Pro/NIb genes showed close relation of onion isolates and their difference from garlic isolates. It also showed differences between Czech isolates and Asian isolates. Isolates imported in consumable garlic from Asia were similar to other Asian isolates. The obtained data agree with original host range and with geographical origin of analyzed viral isolates.
Number of the records: 1