Number of the records: 1
Molekulárně-biologická analýza klinicky významných bakterií
Title statement Molekulárně-biologická analýza klinicky významných bakterií [rukopis] / Michaela Sedláčková Additional Variant Titles Molekulárně biologická analýza klinicky významných bakteríí Personal name Sedláčková, Michaela (dissertant) Translated title Molecular-biology analysis of clinical important bacteria Issue data 2009 Phys.des. 55 s. (65 096 znaků bez mezer) : tab. + 1 CD ROM Note Ved. práce Milan Kolář Another responsib. Kolář, Milan, 1964- (thesis advisor) Sauer, Pavel (opponent) Another responsib. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (degree grantor) Keywords ESBL * beta-laktamázy * CTX-M * Escherichia coli * ESBL * beta-lactamases * CTX-M * Escherichia coli Form, Genre diplomové práce master's theses UDC (043)378.2 Country Česko Language čeština Document kind PUBLIKAČNÍ ČINNOST Title Mgr. Degree program Navazující Degree program Biologie Degreee discipline Molekulární a buněčná biologie book
Call number Barcode Location Sublocation Info DP-KBB/031 (PřF-KBO) 3134510525 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad In-Library Use Only
Tato práce byla zaměřena na průkaz ESBL pozitivních kmenů Escherichia coli izolovaných od pacientů ze dvou velkých Fakultních nemocnic, FN Brno a FN Olomouc. Úkolem bylo určení skupin širokospektrých beta-laktamáz pomocí techniky PCR a metody RFLP a dále stanovení konkrétních typů ESBL pomocí sekvenace a zjištění možného klonálního přenosu s využitím pulzní gelové elektroforézy. U 2O fenotypově potvrzených ESBL producentů Escherichia coli byla genetickou analýzou (PCR) potvrzena přítomnost širokospektrých beta-laktamáz. Převládajícím typem v této práci, stanoveným sekvenací, byl CTX-M-15, vyskytující se v 85% vyšetřovaných vzorků. Ojediněle se vyskytly typy CTX-M-9, CTX-M-9like a CTX-M-27. V obou nemocnicích bylo prokázáno klonální šíření stejných kmenů Escherichia coli. Tyto kmeny se vyskytovaly jako kontaminace či součást běžné lidské mikroflóry, i jako možní původci závažných infekcí (uroinfekce, infekce krevního řečiště). U izolátů z FN Brno bylo prokázáno šíření klonů pouze mezi pacienty v rámci jednoho oddělení. U izolátů z FN Olomouc bylo prokázáno šíření identických klonů Escherichia coli jak v těle jednoho pacienta, tak i mezi pacienty jednoho oddělení, ale navíc i v rámci různých oddělení celé nemocnice, kde byly také častěji možnými původci závažných infekcí, např. v hemokulturách.The study was aimed to determine ESBL positive strains of Escherichia coli, isolated from human clinical material of patients in two large Faculty Hospitals, FN Brno and FN Olomouc. The basic task was determination of groups with extended-spectrum beta-lactamases by PCR-RFLP technique and than the assessment of specific ESBL types by sequencing and detection of possible clonal transfer by pulse field gel electrophoresis application. The presence of extended-spectrum beta-lactamases was validated in group of 20 phenotypically positive ESBL producers of Escherichia coli by the genetic analysis (PCR). The predominant type designated in this study by sequencing was CTX-M-15, occurring in 85% examinated isolates. Sporadically there were found CTX-M9, CTX-M-9like and CTX-M-27 types also. In both hospitals the clonal spreading of identical Escherichia coli strains was detected. These strains were found as a contamination or as a part of natural human microflora as well as a possible source of serious infection (e.g. uroinfection, infectin of blood stream). In the group of isolates from FN Brno, the spread of clones was proved only among patients from one ward. On the other hand at the case of isolates from FN Olomouc, the spread of identical Escherichia coli clone was detected in different sources of one patient, as well as between patients of one ward. Furthermore, the identical clone was detected between different wards around all hospital, where they served as frequent possible-pathogenic agent of serious infections, for example in hemocultures.
Number of the records: 1